scverse / scverse/spatialdata-plot
Interpolation problem for sparse image data?
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- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 86
- Forks
- 21
- Merge medio
- 14 h 50 min
- PR fusionados (30 d)
- 3
Descripción
While improving the Visium HD notebook after https://github.com/scverse/spatialdata-plot/issues/303 has been addressed I have noticed that there must be a problem with interpolations of images when the target canvas is small, because I can't replicate the plot shown in figure with the commented code (when I tried it shows everything black; if I put a large figsize e.g. (30, 30), I start seeing some white pixels).
To reproduce please run the Visium HD notebook.
Guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
Línea de trabajo
Ejecuta el notebook de Visium HD e inspecciona el código de plotting comentado que produce una imagen completamente negra con un canvas de destino pequeño. Compáralo con la figura adjunta y con un figsize grande como (30, 30); se considera terminado cuando la interpolación renderiza la imagen de forma consistente también en el canvas más pequeño.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Evaluación
- Stack tecnológico
- jupyter-notebook, python
- Área
- data-visualization
- Tipo de issue
- Error
- Dificultad
- 3/5
- Tiempo estimado
- 1-2 días
- Estado de actividad
- Tranquilo
- Claridad
- Bastante claro
- Aptitud para principiantes
- 48/100