scverse / scverse/spatialdata-plot
Interpolation problem for sparse image data?
Dieses Issue hat noch niemand übernommen.
- Vorherrschende Sprache
- Python
- Sterne
- 86
- Forks
- 21
- Ø Merge
- 14 Std. 50 Min.
- Gemergte PRs (30 T.)
- 3
Beschreibung
While improving the Visium HD notebook after https://github.com/scverse/spatialdata-plot/issues/303 has been addressed I have noticed that there must be a problem with interpolations of images when the target canvas is small, because I can't replicate the plot shown in figure with the commented code (when I tried it shows everything black; if I put a large figsize e.g. (30, 30), I start seeing some white pixels).
To reproduce please run the Visium HD notebook.
Beitragsleitfaden
Erste Schritte
- Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
- Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
- Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
- Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.
Rechercherichtung
Führe das Visium HD-Notebook aus und untersuche den auskommentierten Plotting-Code, der bei einer kleinen Ziel-Canvas ein vollständig schwarzes Bild erzeugt. Vergleiche es mit der angehängten Abbildung und mit einer großen figsize wie (30, 30); die Aufgabe ist abgeschlossen, wenn die Interpolation das Bild auch auf der kleineren Canvas konsistent rendert.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Bewertung
- Tech-Stack
- jupyter-notebook, python
- Bereich
- data-visualization
- Issue-Typ
- Bug
- Schwierigkeit
- 3/5
- Geschätzter Aufwand
- 1-2 Tage
- Aktivitätsstatus
- Ruhig
- Klarheit
- Größtenteils klar
- Anfängerfreundlichkeit
- 48/100