`isinstance` removes `cls.__dict__["__annotations__"]` in a complex setup with Protocol and ABCMeta

Bug report

Bug description:

import abc
from collections.abc import Iterator
from typing import Protocol

# ---- Expected behavior:
class Steppable(metaclass=abc.ABCMeta):
  pass

class Module:
  @classmethod
  def __init_subclass__(cls, **kwargs) -> None:
    super().__init_subclass__(**kwargs)
    name, annotation, default = "name", str | None, "abc"
    cls.__annotations__[name] = annotation
    setattr(cls, name, default)


class SequenceLayer1(Module, Steppable):
  pass


print(SequenceLayer1.__dict__.get("__annotations__"))
# {'name': str | None}
assert SequenceLayer1.__dict__.get("__annotations__") is not None


# ---- Unexpected behavior:
class CheckpointableIterator(Iterator, Protocol):
  pass

isinstance(CheckpointableIterator, Iterator)

class SequenceLayer2(Module, Steppable):
  pass

print(SequenceLayer2.__dict__.get("__annotations__"))
# None
assert SequenceLayer2.__dict__.get("__annotations__") is not None

• Failing on 3.12 and 3.13
• Passing on 3.11 and 3.14 (For 3.14 it is expected to have __dict__["__annotations__"] missing)

CPython versions tested on:

3.12

Operating systems tested on:

Linux

Chạy reproducer liên quan đến Module.init_subclass, CheckpointableIterator, Protocol, ABCMeta và isinstance trên Python 3.12 và 3.13, sau đó so sánh với 3.11 và 3.14. Theo dõi cách SequenceLayer1 và SequenceLayer2 nhận annotations và xác định vị trí lớp thứ hai mất mục nhập của nó. Hoàn tất khi hành vi được giải thích và một regression test bao phủ khoảng phiên bản bị ảnh hưởng.