go.Scatter3d doesn't display a given tensor
Dieses Issue hat noch niemand übernommen.
- Vorherrschende Sprache
- Python
- Sterne
- 18.8k
- Forks
- 2.8k
- Ø Merge
- 16 Std. 26 Min.
- Gemergte PRs (30 T.)
- 21
Beschreibung
Issue
While plotting an np.ndarray of type fp64, it is not displayed.
It is so funny that we could reproduce it only for one specific array.
Thigs that make the script work:
- If we add epsilon (as in the commented line), then the pointcloud is displayed properly.
- If we cast to fp32 it works.
- If we add a small value (0.000000000001 for example), it works.
Things that doesn't work:
- If we add or substract big values, like 0.4, 1 or 2, it doesn't work
- If we substract epsilon, it doesn't work
- if we add numbers larger than 0.000000000001, it doesnt' work even if tehy are small (0.000001 for example)
Environment
We tried this (and reproduced in at least 2 computers) with numpy 1.26.3 and plotly 5.18.0 on ubuntu 22
import numpy as np
import plotly.graph_objects as go
init = np.array(
[
[
-0.063,
-0.063,
0.0,
],
[
-0.063,
-0.021,
0.0,
],
[
-0.063,
0.021,
0.0,
],
[
-0.063,
0.063,
0.0,
],
[
-0.021,
-0.021,
0.0,
],
[
-0.021,
-0.063,
0.0,
],
[
-0.021,
0.021,
0.0,
],
[
-0.021,
0.063,
0.0,
],
[
0.021,
-0.063,
0.0,
],
[
0.021,
-0.021,
0.0,
],
[
0.021,
0.021,
0.0,
],
[
0.021,
0.063,
0.0,
],
[
0.063,
-0.063,
0.0,
],
[
0.063,
-0.021,
0.0,
],
[
0.063,
0.021,
0.0,
],
[
0.063,
0.063,
0.0,
],
]
)
rot_mat = [
[4.93038066e-32, -1.00000000e00, 2.22044605e-16],
[2.22044605e-16, 2.22044605e-16, 1.00000000e00],
[-1.00000000e00, 0.00000000e00, 2.22044605e-16],
]
transformed = (rot_mat @ init.T).T + np.array([0.5, 0.5, 0.5])
x, y, z = 0, 1, 2
idx = list(transformed.shape).index(3)
if idx < 0:
raise ValueError("Array must be [X,Y,Z] x N")
elif idx == 1:
array = transformed.transpose()
default_kwargs = dict(
mode="markers",
marker=dict(size=3, color="black"),
)
print(array.dtype)
# array[y]+=np.finfo(np.float64).eps
print(array.dtype)
print(array)
plot = go.Scatter3d(x=array[x], y=array[y], z=array[z], **default_kwargs)
default_kwargs = dict(
scene=dict(
xaxis=dict(title="X", range=[0, 2]),
yaxis=dict(title="Y", range=[0, 2]),
zaxis=dict(title="Z", range=[0, 2]),
),
)
layout = go.Layout(**default_kwargs)
fig = go.Figure(data=plot, layout=layout)
fig.show()
Beitragsleitfaden
Erste Schritte
- Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
- Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
- Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
- Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.
Rechercherichtung
Verwende das bereitgestellte Reproduktionsskript als Einstiegspunkt und führe es mit numpy 1.26.3 und plotly 5.18.0 auf Ubuntu 22 aus. Vergleiche das fehlschlagende fp64-Array mit den funktionierenden epsilon- und fp32-Varianten und verfolge anschließend den go.Scatter3d-Renderingpfad. Als erledigt gilt die Aufgabe, wenn die Ursache identifiziert und eine Regression-Prüfung hinzugefügt wurde, die zeigt, dass der angegebene Tensor angezeigt wird.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Bewertung
- Tech-Stack
- numpy, plotly, python
- Bereich
- data-visualization
- Issue-Typ
- Bug
- Schwierigkeit
- 4/5
- Geschätzter Aufwand
- 3-5 Tage
- Aktivitätsstatus
- Veraltet
- Klarheit
- Größtenteils klar
- Anfängerfreundlichkeit
- 38/100