add "Non-leaves rows are not permitted in the dataframe" with sunburst diagrams
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- Linguagem predominante
- Python
- Estrelas
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- 2.8k
- Merge médio
- 16h 26min
- PRs com merge (30d)
- 21
Descrição
It is sometimes useful to have non-leaf data in a Sunburst diagram. However, there is no way to tell Plotly Express to ignore or accept non-leaves.
Minimum viable example:
import pandas as pd
import plotly.express as px
lst = [['Alice', "Bob"], ['Alice', "Bob", "Carrie"], ["Alice", "Bob", "Chuck"]]
df = pd.DataFrame(lst)
fig = px.sunburst(df, path=df.columns)
Gives the error:
ValueError: ('Non-leaves rows are not permitted in the dataframe \n', 0 Alice
1 Bob
2
Name: 0, dtype: object, 'is not a leaf.')
This can be fixed by commenting out part of plotly/express/_core.py
def _check_dataframe_all_leaves(df):
df_sorted = df.sort_values(by=list(df.columns))
null_mask = df_sorted.isnull()
df_sorted = df_sorted.astype(str)
null_indices = np.nonzero(null_mask.any(axis=1).values)[0]
for null_row_index in null_indices:
row = null_mask.iloc[null_row_index]
i = np.nonzero(row.values)[0][0]
if not row[i:].all():
raise ValueError(
"None entries cannot have not-None children",
df_sorted.iloc[null_row_index],
)
df_sorted[null_mask] = ""
row_strings = list(df_sorted.apply(lambda x: "".join(x), axis=1))
#for i, row in enumerate(row_strings[:-1]):
#if row_strings[i + 1] in row and (i + 1) in null_indices:
#raise ValueError(
# "Non-leaves rows are not permitted in the dataframe \n",
# df_sorted.iloc[i + 1],
# "is not a leaf.",
#)
It would be great if px.sunburst could have an option to disable these checks, or to skip over any row which is not a leaf.
How can I propose this as an option?
Thanks!
Guia de contribuição
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
Direção de pesquisa
Comece em plotly/express/_core.py, em _check_dataframe_all_leaves, e reproduza o problema com o exemplo fornecido usando pandas e px.sunburst. Investigue como px.sunburst poderia expor uma opção para aceitar ou ignorar linhas que não são folhas e defina como concluído quando o exemplo não gerar mais o erro atual de linhas não folha com essa opção habilitada.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Avaliação
- Stack de tecnologia
- python
- Domínio
- data-visualization
- Tipo de issue
- Funcionalidade
- Dificuldade
- 4/5
- Tempo estimado
- 3-5 dias
- Status de atividade
- Estagnada
- Clareza
- Razoavelmente clara
- Facilidade para iniciantes
- 35/100