issue using sctk package for geom2trace function
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- Langage dominant
- R
- Étoiles
- 2.7k
- Forks
- 641
- Métriques de merge des PR
- Aucune PR mergée en 30 j
Description
While executing SCTK pipeline (using the newest docker image, see : https://sctk.bu.edu/app/SingleCellTK), I encountered following issue trying to plot different UMAP visualizations.
UMAP Complete
Warning in geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomTextRepel() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
I would like to ask if this functionality can be considered for next update of the software?
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Piste de recherche
Commencez par reproduire la visualisation UMAP de SCTK qui déclenche geom2trace.default et l’avertissement geom_GeomTextRepel dans la dernière image Docker. Le payload ne nomme aucun fichier source ni aucun test ; localisez donc d’abord l’implémentation de geom2trace et les gestionnaires geom existants. Le travail est terminé lorsque ce geom est pris en charge sans l’avertissement signalé.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Évaluation
- Stack technique
- plotly, r
- Domaine
- data-visualization
- Type d'issue
- Fonctionnalité
- Difficulté
- 5/5
- Temps estimé
- Plus d'une semaine
- Activité
- À l'abandon
- Clarté
- À clarifier
- Accessibilité débutants
- 25/100