plotly / plotly/plotly.R

R session hangs up after using ggplotly()

Đang mở
#2,318 1 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Ngôn ngữ chính
R
Star
2.7k
Fork
641
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

My R session (within RStudio) hangs up after using ggplotly().
For testing, I use one of the examples of ?ggplotly. The example normally works ok once or twice, but the R session hangs up after several tries (in the example below, the 2nd run hung up the session). I cannot even close RStudio from within the GUI and have to use the System Monitor application to kill it.
This problem arises when I run the following code after I have loaded a given project, not if I start a R session with no project. However, the project does not load any data or package, so I do not know how to identify the problem.
This is what I specifically do:


> ls()
    character(0)
    > search()
     [1] ".GlobalEnv"        "tools:rstudio"     "package:stats"     "package:graphics"  "package:grDevices"
     [6] "package:utils"     "package:datasets"  "package:methods"   "Autoloads"         "package:base"     
    > sessionInfo()
    R version 4.1.2 (2021-11-01)
    Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
    Running under: Pop!_OS 22.04 LTS
    
    Matrix products: default
    BLAS:   /usr/lib/x86_64-linux-gnu/openblas-pthread/libblas.so.3
    LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/openblas-pthread/libopenblasp-r0.3.20.so
    
    locale:
     [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=es_ES.UTF-8       
     [4] LC_COLLATE=en_US.UTF-8     LC_MONETARY=es_ES.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
     [7] LC_PAPER=es_ES.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C              
    [10] LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=es_ES.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       
    
    attached base packages:
    [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
    
    loaded via a namespace (and not attached):
     [1] rgl_1.2.1              Rcpp_1.0.11            class_7.3-20           digest_0.6.33         
     [5] kml_2.4.6              R6_2.5.1               plyr_1.8.9             jsonlite_1.8.7        
     [9] magrittr_2.0.3         evaluate_0.22          rlang_1.1.1            longitudinalData_2.4.5
    [13] cli_3.6.1              misc3d_0.9-1           rstudioapi_0.15.0      rmarkdown_2.25        
    [17] tools_4.1.2            htmlwidgets_1.6.2      clv_0.3-2.4            xfun_0.40             
    [21] yaml_2.3.7             fastmap_1.1.1          compiler_4.1.2         base64enc_0.1-3       
    [25] cluster_2.1.2          tcltk_4.1.2            htmltools_0.5.6.1      knitr_1.44            
    
    > library(ggplot2)
    > library(plotly)

Attaching package: ‘plotly’

The following object is masked from ‘package:ggplot2’:

    last_plot

The following object is masked from ‘package:stats’:

    filter

The following object is masked from ‘package:graphics’:

    layout
    > data(canada.cities, package = "maps")
    > viz <- ggplot(canada.cities, aes(long, lat)) +
    +     borders(regions = "canada") +
    +     coord_equal() +
    +     geom_point(aes(text = name, size = pop), colour = "red", alpha = 1/2)
    Warning message:
    In geom_point(aes(text = name, size = pop), colour = "red", alpha = 1/2) :
      Ignoring unknown aesthetics: text
    > ggplotly(viz, tooltip = c("text", "size"))
    > 
    > 
    > 
    > 
    > data(canada.cities, package = "maps")
    > viz <- ggplot(canada.cities, aes(long, lat)) +
    +     borders(regions = "canada") +
    +     coord_equal() +
    +     geom_point(aes(text = name, size = pop), colour = "red", alpha = 1/2)
    Warning message:
    In geom_point(aes(text = name, size = pop), colour = "red", alpha = 1/2) :
      Ignoring unknown aesthetics: text
    > ggplotly(viz, tooltip = c("text", "size"))
    > 
    > 

Hướng dẫn đóng góp

Mở hướng dẫn đóng góp

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách tái hiện ví dụ ggplotly(viz, tooltip = c("text", "size")) được cung cấp trong một project và trong một session không có project, đồng thời ghi lại sessionInfo() và các package đã được nạp được hiển thị. So sánh hai môi trường và lần theo entry point của ggplotly(); công việc được xem là hoàn tất khi hiện tượng treo đã được tái hiện với nguyên nhân được xác nhận và một cách giải quyết đã được kiểm chứng.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Đánh giá

Công nghệ
r
Lĩnh vực
data-visualization
Loại issue
Lỗi
Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức phù hợp với người mới
25/100

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.