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R session hangs up after using ggplotly()

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R
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Beschreibung

My R session (within RStudio) hangs up after using ggplotly().
For testing, I use one of the examples of ?ggplotly. The example normally works ok once or twice, but the R session hangs up after several tries (in the example below, the 2nd run hung up the session). I cannot even close RStudio from within the GUI and have to use the System Monitor application to kill it.
This problem arises when I run the following code after I have loaded a given project, not if I start a R session with no project. However, the project does not load any data or package, so I do not know how to identify the problem.
This is what I specifically do:


> ls()
    character(0)
    > search()
     [1] ".GlobalEnv"        "tools:rstudio"     "package:stats"     "package:graphics"  "package:grDevices"
     [6] "package:utils"     "package:datasets"  "package:methods"   "Autoloads"         "package:base"     
    > sessionInfo()
    R version 4.1.2 (2021-11-01)
    Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
    Running under: Pop!_OS 22.04 LTS
    
    Matrix products: default
    BLAS:   /usr/lib/x86_64-linux-gnu/openblas-pthread/libblas.so.3
    LAPACK: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/openblas-pthread/libopenblasp-r0.3.20.so
    
    locale:
     [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=es_ES.UTF-8       
     [4] LC_COLLATE=en_US.UTF-8     LC_MONETARY=es_ES.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
     [7] LC_PAPER=es_ES.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C              
    [10] LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=es_ES.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       
    
    attached base packages:
    [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
    
    loaded via a namespace (and not attached):
     [1] rgl_1.2.1              Rcpp_1.0.11            class_7.3-20           digest_0.6.33         
     [5] kml_2.4.6              R6_2.5.1               plyr_1.8.9             jsonlite_1.8.7        
     [9] magrittr_2.0.3         evaluate_0.22          rlang_1.1.1            longitudinalData_2.4.5
    [13] cli_3.6.1              misc3d_0.9-1           rstudioapi_0.15.0      rmarkdown_2.25        
    [17] tools_4.1.2            htmlwidgets_1.6.2      clv_0.3-2.4            xfun_0.40             
    [21] yaml_2.3.7             fastmap_1.1.1          compiler_4.1.2         base64enc_0.1-3       
    [25] cluster_2.1.2          tcltk_4.1.2            htmltools_0.5.6.1      knitr_1.44            
    
    > library(ggplot2)
    > library(plotly)

Attaching package: ‘plotly’

The following object is masked from ‘package:ggplot2’:

    last_plot

The following object is masked from ‘package:stats’:

    filter

The following object is masked from ‘package:graphics’:

    layout
    > data(canada.cities, package = "maps")
    > viz <- ggplot(canada.cities, aes(long, lat)) +
    +     borders(regions = "canada") +
    +     coord_equal() +
    +     geom_point(aes(text = name, size = pop), colour = "red", alpha = 1/2)
    Warning message:
    In geom_point(aes(text = name, size = pop), colour = "red", alpha = 1/2) :
      Ignoring unknown aesthetics: text
    > ggplotly(viz, tooltip = c("text", "size"))
    > 
    > 
    > 
    > 
    > data(canada.cities, package = "maps")
    > viz <- ggplot(canada.cities, aes(long, lat)) +
    +     borders(regions = "canada") +
    +     coord_equal() +
    +     geom_point(aes(text = name, size = pop), colour = "red", alpha = 1/2)
    Warning message:
    In geom_point(aes(text = name, size = pop), colour = "red", alpha = 1/2) :
      Ignoring unknown aesthetics: text
    > ggplotly(viz, tooltip = c("text", "size"))
    > 
    > 

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Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Beginne damit, das bereitgestellte ggplotly(viz, tooltip = c("text", "size"))-Beispiel in einem Projekt und in einer Sitzung ohne Projekt zu reproduzieren und dabei die angezeigte sessionInfo() sowie die geladenen Pakete zu dokumentieren. Vergleiche die beiden Umgebungen und verfolge den Einstiegspunkt von ggplotly(); als abgeschlossen gilt die Aufgabe, wenn der Hänger mit bestätigter Ursache reproduziert und eine Lösung verifiziert wurde.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
r
Bereich
data-visualization
Issue-Typ
Bug
Schwierigkeit
4/5
Geschätzter Aufwand
3-5 Tage
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Muss geklärt werden
Anfängerfreundlichkeit
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