plotly / plotly/plotly.R

geom_text_repel has not been yet implemented into plotly

Aberta
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Ninguém assumiu esta issue ainda.

Linguagem predominante
R
Estrelas
2.7k
Forks
641
Métricas de merge de PRs
Nenhum PR com merge em 30d

Descrição

I want to build a phylogenetic tree from a newick file with ggplotly function but as soon as I use geom_text_repel to avoid overlapping between branches and labels, it says that this function is not yet implemented. The geom_text works only by itself but there is a lot of ovelap. Do you know anything that can help instead? Here is a small example.

library(ggtree)
library(plotly)

treefile <- "filename.newick"
tree <- read.tree(treefile)
p1 <- ggtree(tree)
p1 + geom_text_repel()
plotly::ggplotly(p1)

Guia de contribuição

Abrir o guia de contribuição

Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

Direção de pesquisa

Comece com o exemplo mínimo de ggtree/Newick e o ponto de entrada plotly::ggplotly(p1), comparando o comportamento existente de geom_text com a rejeição relatada de geom_text_repel. O trabalho estará concluído quando ggplotly aceitar geom_text_repel para este caso de uso e evitar o problema relatado de sobreposição de rótulos.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Avaliação

Stack de tecnologia
r
Domínio
data-visualization
Tipo de issue
Funcionalidade
Dificuldade
5/5
Tempo estimado
Mais de uma semana
Status de atividade
Estagnada
Clareza
Razoavelmente clara
Facilidade para iniciantes
35/100

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