plotly / plotly/plotly.R

geom_text_repel has not been yet implemented into plotly

Offen
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Vorherrschende Sprache
R
Sterne
2.7k
Forks
641
PR-Merge-Kennzahlen
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beschreibung

I want to build a phylogenetic tree from a newick file with ggplotly function but as soon as I use geom_text_repel to avoid overlapping between branches and labels, it says that this function is not yet implemented. The geom_text works only by itself but there is a lot of ovelap. Do you know anything that can help instead? Here is a small example.

library(ggtree)
library(plotly)

treefile <- "filename.newick"
tree <- read.tree(treefile)
p1 <- ggtree(tree)
p1 + geom_text_repel()
plotly::ggplotly(p1)

Beitragsleitfaden

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Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Beginne mit dem minimalen ggtree/Newick-Beispiel und dem Einstiegspunkt plotly::ggplotly(p1), wobei das bestehende Verhalten von geom_text mit der gemeldeten Ablehnung von geom_text_repel verglichen wird. Als abgeschlossen gilt die Aufgabe, wenn ggplotly geom_text_repel für diesen Anwendungsfall akzeptiert und das gemeldete Problem der Label-Überlappung vermeidet.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
r
Bereich
data-visualization
Issue-Typ
Feature
Schwierigkeit
5/5
Geschätzter Aufwand
Über eine Woche
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Größtenteils klar
Anfängerfreundlichkeit
35/100

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