plotly / plotly/plotly.R

geom_text_repel has not been yet implemented into plotly

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Lenguaje dominante
R
Estrellas
2.7k
Forks
641
Métricas de merge de PR
Sin PR fusionados en 30 d

Descripción

I want to build a phylogenetic tree from a newick file with ggplotly function but as soon as I use geom_text_repel to avoid overlapping between branches and labels, it says that this function is not yet implemented. The geom_text works only by itself but there is a lot of ovelap. Do you know anything that can help instead? Here is a small example.

library(ggtree)
library(plotly)

treefile <- "filename.newick"
tree <- read.tree(treefile)
p1 <- ggtree(tree)
p1 + geom_text_repel()
plotly::ggplotly(p1)

Guía de contribución

Abrir la guía de contribución

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

Línea de trabajo

Comienza con el ejemplo mínimo de ggtree/Newick y el punto de entrada plotly::ggplotly(p1), comparando el comportamiento existente de geom_text con el rechazo informado de geom_text_repel. El trabajo estará terminado cuando ggplotly acepte geom_text_repel para este caso de uso y evite el problema informado de superposición de etiquetas.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Evaluación

Stack tecnológico
r
Área
data-visualization
Tipo de issue
Nueva funcionalidad
Dificultad
5/5
Tiempo estimado
Más de una semana
Estado de actividad
Estancado
Claridad
Bastante claro
Aptitud para principiantes
35/100

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