Visualization: if column 'XValues' not provided and multiple conditions should be plotted automatically
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評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 45/100
- issue の種類
- 機能追加
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 停滞
- 技術スタック
- python
調査の方向性
Start with the visualization-table handling for the XValues column, then review how measurement time and the first condition-file column currently select plots. Use the PEtab-dev/PEtab#283 conversation and the linked supplementary example as context. Done means automatically plotting all conditions, including multiple dose-response subplots when XValues is absent.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
If in the visualization table, the column XValues is not provided, it is inferred:
- if in measurement file measurement time is not constant, then XValues = 'time' ->plot time course
- if its constant, then dose response plots are plotted. For now, only the first column in the condition file is taken into account.
Expand to automatically plot all conditions. Ideally like subplots B and C in:
https://journals.plos.org/ploscompbiol/article/file?type=supplementary&id=info:doi/10.1371/journal.pcbi.1007147.s005
see conversation in PEtab-dev/PEtab#283.
- 主要言語
- Python
- スター
- 18
- フォーク
- 9
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
コントリビューションガイド
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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