higlass / higlass/higlass-python

Tileset info not found with custom data

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Lingua principale
Python
Stelle
66
Fork
11
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Descrizione

Hi,

I tried the example code from https://docs.higlass.io/jupyter.html#numpy-matrix.
```
import numpy as np

dim = 2000
I, J = np.indices((dim, dim))
data = (
-(J + 47) * np.sin(np.sqrt(np.abs(I / 2 + (J + 47))))
- I * np.sin(np.sqrt(np.abs(I - (J + 47))))
)

from clodius.tiles import npmatrix
from higlass.tilesets import Tileset

ts = Tileset(
tileset_info=lambda: npmatrix.tileset_info(data),
tiles=lambda tids: npmatrix.tiles_wrapper(data, tids)
)

display, server, viewconf = higlass.display([
View([
Track(track_type='top-axis', position='top'),
Track(track_type='left-axis', position='left'),
Track(track_type='heatmap',
position='center',
tileset=ts,
height=250,
options={ 'valueScaleMax': 0.5 }),

])
])
display
```
And I got this
tilesetinfo
And this is when I try `ts.tileset_info()`
tilesetinfo2
Could you give me some suggestions on how to solve this?
Thank you!

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