Python modules should be organized according to their location in the file system

In the official implementation, Python modules are organized according to their location in the file system. If we follow this rule, it will be friendly to those migrating from then official.

ref:
- https://developers.google.com/protocol-buffers/docs/proto3#packages

Es sind keine Quelldateien, Tests oder Einstiegspunkte angegeben. Beginne damit, die Logik zur Python-Modulgenerierung zu finden und ihr aktuelles Verhalten mit den verlinkten Richtlinien für Protocol-Buffers-Pakete zu vergleichen; definiere das erwartete Layout der generierten Dateien und überprüfe es mit gezielten Generator-Tests.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.