pyls cannot be initialized if I closed atom with clicking title bar last time

Ok, here is the thing. If I close atom with clicking title bar, next time, when I have to close all files, and re-open them, or I cannot connect to pyls. However if I close atom with cmd+w, then next time all files can automatically connect to pyls.

OS: mac OS and everything is last version.

Nenhum arquivo, teste ou ponto de entrada do código é especificado. Reproduza o comportamento do macOS fechando o Atom pela barra de título e com cmd+w, depois acompanhe a inicialização e a reconexão do pyls; está concluído quando os arquivos se conectarem ao pyls após reabri-lo pelos dois caminhos.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.