pyls cannot be initialized if I closed atom with clicking title bar last time

Ok, here is the thing. If I close atom with clicking title bar, next time, when I have to close all files, and re-open them, or I cannot connect to pyls. However if I close atom with cmd+w, then next time all files can automatically connect to pyls.

OS: mac OS and everything is last version.

No se especifica ningún archivo, prueba ni punto de entrada de código. Reproduce el comportamiento de macOS cerrando Atom desde la barra de título frente a cmd+w; después, sigue la inicialización y la reconexión de pyls. Se considera terminado cuando los archivos se conectan a pyls después de volver a abrirlo mediante ambas rutas.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.