ide-python not fully functional with v1.0.0

Hi! I've discovered that with version v1.0.0, although the linter and isort plugin is working fine, the jedi tip and hyperclick is not working.

This is my current procedure:

1. Use pyenv to create a virtualenv
2. Use pip or poetry to install python-language-server with the [all] option
3. activate the venv so that "which python" links to the venv one
4. Start atom from the terminal with the above python pointing to the venv one.
5. Start a script and finds out that only basic functioning like linter, outline and find reference is working. On the other hand, jedi tips and hyperclick is not working correctly.

**Detail on point 5:**

I've found that the with built-in module like os or time, only the jedi hover is working. The pip installed one such as numpy or pandas show no jedi hover.

And all modules imported can't be hyperclicked.

---

Is there anything I can do to help test this?

Tái hiện vấn đề bằng cách sử dụng thiết lập pyenv virtualenv và python-language-server [all] đã được báo cáo, sau đó so sánh hành vi hover của Jedi đối với các module tích hợp sẵn với các module numpy hoặc pandas đã cài đặt. Đồng thời xác minh hành vi của hyperclick đối với các import; được xem là hoàn tất khi các gợi ý của Jedi hoạt động với các module đã cài đặt và có thể hyperclick vào các module đã import.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.