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Conda-install-error

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D
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52
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6
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描述

when I run "snakemake --configfile=snakemake.yml --use-conda" or "snakemake --configfile=snakemake.yml --use-conda --profile=slurm"
it told me that "SyntaxError in line 920 of /public/home/GL_lixn/biosoft/dentist.v3.0.0.x86_64/Snakefile:
Unexpected keyword container in rule definition (Snakefile, line 920)"

贡献指南

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调研方向

该错误指向 Snakefile 第 920 行,其中在规则定义中使用了意外的关键字 'container'。首先,检查该行附近的 Snakefile,以了解规则语法和无效关键字。然后,查阅 Snakemake 文档,了解正确的规则定义以及 --use-conda 标志的用法。接着,在本地运行该命令以复现错误并验证修复。

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评估

领域
bioinformatics, build-system
Issue 类型
缺陷
难度
3/5
预计耗时
1-2 天
活跃度
停滞
描述清晰度
基本清楚
新手友好度
45/100

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