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Conda-install-error

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Langage dominant
D
Étoiles
52
Forks
6
Métriques de merge des PR
Aucune PR mergée en 30 j

Description

when I run "snakemake --configfile=snakemake.yml --use-conda" or "snakemake --configfile=snakemake.yml --use-conda --profile=slurm"
it told me that "SyntaxError in line 920 of /public/home/GL_lixn/biosoft/dentist.v3.0.0.x86_64/Snakefile:
Unexpected keyword container in rule definition (Snakefile, line 920)"

Guide de contribution

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Piste de recherche

L’erreur pointe vers la ligne 920 du Snakefile, où le mot-clé inattendu 'container' est utilisé dans la définition d’une règle. Commencez par examiner le Snakefile autour de cette ligne afin de comprendre la syntaxe de la règle et le mot-clé invalide. Consultez ensuite la documentation de Snakemake pour connaître les définitions correctes des règles et l’utilisation de l’option --use-conda. Testez enfin l’exécution de la commande en local afin de reproduire l’erreur et de vérifier la correction.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Domaine
bioinformatics, build-system
Type d'issue
Bug
Difficulté
3/5
Temps estimé
1-2 jours
Activité
À l'abandon
Clarté
Plutôt claire
Accessibilité débutants
45/100

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