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run error in monailabel

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Langage dominant
Jupyter Notebook
Étoiles
2.5k
Forks
803
Merge moyen
6 j 22 h
PR mergées (30 j)
3

Description

Hello, thank you very much for your great work on MONAI Label.

When I tried to run the following command:
monailabel start_server --app apps/monaibundle --studies datasets/venous_liver --conf models pancreas_ct_dints_segmentation
I encountered this error:
File "D:\anaconda\envs\monailabel\lib\site-packages\monai\bundle\config_item.py", line 374, in evaluate return eval(value[len(self.prefix) :], globals_, locals) File "<string>", line 1, in <module> File "D:\anaconda\envs\monailabel\lib\site-packages\torch\serialization.py", line 1524, in load raise pickle.UnpicklingError(_get_wo_message(str(e))) from None _pickle.UnpicklingError: Weights only load failed. This file can still be loaded, to do so you have two options, do those steps only if you trust the source of the checkpoint. (1) In PyTorch 2.6, we changed the default value of the weights_onlyargument intorch.loadfromFalsetoTrue. Re-running torch.loadwithweights_onlyset toFalsewill likely succeed, but it can result in arbitrary code execution. Do it only if you got the file from a trusted source. (2) Alternatively, to load withweights_only=Trueplease check the recommended steps in the following error message. WeightsUnpickler error: Unsupported global: GLOBAL numpy.core.multiarray._reconstruct was not an allowed global by default. Please usetorch.serialization.add_safe_globals([numpy.core.multiarray._reconstruct])or thetorch.serialization.safe_globals([numpy.core.multiarray._reconstruct])context manager to allowlist this global if you trust this class/function.
`RuntimeError: Failed to evaluate ConfigExpression:
"$torch.load(__local_refs['arch_ckpt_path'], map_location=torch.device('cuda'))"

[2025-07-07 21:02:28,103] [19056] [MainThread] [ERROR] (uvicorn.error:59) - Application startup failed. Exiting.`

Here is my PyTorch version:
Name: torch Version: 2.7.1+cu128 Summary: Tensors and Dynamic neural networks in Python with strong GPU acceleration Home-page: https://pytorch.org/ Author: PyTorch Team Author-email: packages@pytorch.org License: BSD-3-Clause Location: d:\anaconda\envs\monailabel\lib\site-packages Requires: filelock, fsspec, jinja2, networkx, sympy, typing-extensions Required-by: lpips, monai, pytorch-ignite, sam2, torchaudio, torchio, torchvision

Could you please advise me on how to properly resolve this issue?

Thank you very much for your time and help!

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Piste de recherche

Commencez par reproduire la commande monailabel start_server signalée avec PyTorch 2.7.1 et examinez l’expression torch.load dans l’erreur. Confirmez si le comportement de chargement du checkpoint est causé par la version de PyTorch signalée et définissez l’achèvement comme un moyen documenté ou vérifié de démarrer l’application sans cette erreur.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
python, pytorch
Domaine
machine-learning
Type d'issue
Bug
Difficulté
4/5
Temps estimé
3-5 jours
Activité
À l'abandon
Clarté
À clarifier
Accessibilité débutants
25/100

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