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run error in monailabel

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Vorherrschende Sprache
Jupyter Notebook
Sterne
2.5k
Forks
803
Ø Merge
6 T. 22 Std.
Gemergte PRs (30 T.)
3

Beschreibung

Hello, thank you very much for your great work on MONAI Label.

When I tried to run the following command:
monailabel start_server --app apps/monaibundle --studies datasets/venous_liver --conf models pancreas_ct_dints_segmentation
I encountered this error:
File "D:\anaconda\envs\monailabel\lib\site-packages\monai\bundle\config_item.py", line 374, in evaluate return eval(value[len(self.prefix) :], globals_, locals) File "<string>", line 1, in <module> File "D:\anaconda\envs\monailabel\lib\site-packages\torch\serialization.py", line 1524, in load raise pickle.UnpicklingError(_get_wo_message(str(e))) from None _pickle.UnpicklingError: Weights only load failed. This file can still be loaded, to do so you have two options, do those steps only if you trust the source of the checkpoint. (1) In PyTorch 2.6, we changed the default value of the weights_onlyargument intorch.loadfromFalsetoTrue. Re-running torch.loadwithweights_onlyset toFalsewill likely succeed, but it can result in arbitrary code execution. Do it only if you got the file from a trusted source. (2) Alternatively, to load withweights_only=Trueplease check the recommended steps in the following error message. WeightsUnpickler error: Unsupported global: GLOBAL numpy.core.multiarray._reconstruct was not an allowed global by default. Please usetorch.serialization.add_safe_globals([numpy.core.multiarray._reconstruct])or thetorch.serialization.safe_globals([numpy.core.multiarray._reconstruct])context manager to allowlist this global if you trust this class/function.
`RuntimeError: Failed to evaluate ConfigExpression:
"$torch.load(__local_refs['arch_ckpt_path'], map_location=torch.device('cuda'))"

[2025-07-07 21:02:28,103] [19056] [MainThread] [ERROR] (uvicorn.error:59) - Application startup failed. Exiting.`

Here is my PyTorch version:
Name: torch Version: 2.7.1+cu128 Summary: Tensors and Dynamic neural networks in Python with strong GPU acceleration Home-page: https://pytorch.org/ Author: PyTorch Team Author-email: packages@pytorch.org License: BSD-3-Clause Location: d:\anaconda\envs\monailabel\lib\site-packages Requires: filelock, fsspec, jinja2, networkx, sympy, typing-extensions Required-by: lpips, monai, pytorch-ignite, sam2, torchaudio, torchio, torchvision

Could you please advise me on how to properly resolve this issue?

Thank you very much for your time and help!

Beitragsleitfaden

Beitragsleitfaden öffnen

Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Beginne damit, den gemeldeten monailabel start_server-Befehl mit PyTorch 2.7.1 zu reproduzieren, und untersuche den torch.load-Ausdruck in der Fehlermeldung. Bestätige, ob das Verhalten beim Laden des Checkpoints durch die gemeldete PyTorch-Version verursacht wird, und definiere den Abschluss als eine dokumentierte oder verifizierte Möglichkeit, die Anwendung ohne diesen Fehler zu starten.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
python, pytorch
Bereich
machine-learning
Issue-Typ
Bug
Schwierigkeit
4/5
Geschätzter Aufwand
3-5 Tage
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Muss geklärt werden
Anfängerfreundlichkeit
25/100

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