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endoscopy example doesn't work out of the box

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Langage dominant
Jupyter Notebook
Étoiles
2.5k
Forks
803
Merge moyen
6 j 22 h
PR mergées (30 j)
3

Description

The endoscopy example needs the endovis data, but this isn't referred to on the page, nor are there any instructions for downloading the correct data. We downloaded a sample set from a MONAI tutorial, and this gave us 9 jpg frames. When we started the MONAI label server, all 9 frames were loaded in slicer. I imagine this should have been just 1 file so that we could do the segmentation and then get the next frame.

More info on how to get the example running on the README would be beneficial.

Guide de contribution

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Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
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Piste de recherche

Commencer par le README de l’exemple d’endoscopie et vérifier les données endovis attendues par le serveur MONAI Label dans Slicer. Documenter où télécharger les données correctes et comment lancer l’exemple ; le travail sera terminé lorsqu’un nouvel utilisateur pourra charger les données prévues et poursuivre le workflow de segmentation.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
jupyter-notebook, pytorch
Domaine
documentation
Type d'issue
Documentation
Difficulté
2/5
Temps estimé
1-3 heures
Activité
À l'abandon
Clarté
Plutôt claire
Accessibilité débutants
45/100

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