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endoscopy example doesn't work out of the box

Offen
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Vorherrschende Sprache
Jupyter Notebook
Sterne
2.5k
Forks
803
Ø Merge
6 T. 22 Std.
Gemergte PRs (30 T.)
3

Beschreibung

The endoscopy example needs the endovis data, but this isn't referred to on the page, nor are there any instructions for downloading the correct data. We downloaded a sample set from a MONAI tutorial, and this gave us 9 jpg frames. When we started the MONAI label server, all 9 frames were loaded in slicer. I imagine this should have been just 1 file so that we could do the segmentation and then get the next frame.

More info on how to get the example running on the README would be beneficial.

Beitragsleitfaden

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Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Beginne mit der README des Endoskopie-Beispiels und überprüfe die vom MONAI Label-Server in Slicer erwarteten endovis-Daten. Dokumentiere, wo die richtigen Daten heruntergeladen werden können und wie das Beispiel gestartet wird; abgeschlossen ist die Aufgabe, wenn ein neuer Benutzer die vorgesehenen Daten laden und den Segmentierungsworkflow durchlaufen kann.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
jupyter-notebook, pytorch
Bereich
documentation
Issue-Typ
Dokumentation
Schwierigkeit
2/5
Geschätzter Aufwand
1-3 Stunden
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Größtenteils klar
Anfängerfreundlichkeit
45/100

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