PEtab-dev / PEtab-dev/libpetab-python

add: plotting STD if the column noiseParameter has values and no replicates available

Đang mở
#3 1 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

visualization
Ngôn ngữ chính
Python
Star
18
Fork
9
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

e.g. the Chen model has specified noiseParameters in the measurement data, and no replicate measurement data is available. (so, standard deviation cant be calculated from replicates)
For plotting the standard deviation if no measurement replicates are available, and the column noiseParameters has values, plot these values as standard deviation.

Hướng dẫn đóng góp

Mở hướng dẫn đóng góp

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Hướng nghiên cứu

Start by locating the plotting entry point that handles measurement replicates and the noiseParameter column. Check the Chen-model case described in the issue, then verify that noiseParameter values are used as standard deviation only when replicates are unavailable and those values exist.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Đánh giá

Công nghệ
python
Lĩnh vực
data-visualization
Loại issue
Tính năng
Độ khó
3/5
Thời gian dự kiến
1-2 ngày
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức phù hợp với người mới
45/100

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.