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Improve error handling in Problem.from_yaml - format_version

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validation
Linguagem predominante
Python
Estrelas
18
Forks
9
Métricas de merge de PRs
Nenhum PR com merge em 30d

Descrição

Missing format_version in the yaml file should provide a proper error message instead of just KeyError:

--> 250 if yaml_config[FORMAT_VERSION] not in {"1", 1, "1.0.0", "2.0.0"}:
    251     raise ValueError("Provided PEtab files are of unsupported version "
    252                      f"{yaml_config[FORMAT_VERSION]}. Expected "
    253                      f"{format_version.__format_version__}.")
    254 if yaml_config[FORMAT_VERSION] == "2.0.0":

KeyError: 'format_version'

Guia de contribuição

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Primeiros passos

  1. Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
  2. Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
  3. Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
  4. Abra um pull request que referencie o número da issue.

Direção de pesquisa

Start at the Problem.from_yaml entry point and reproduce the failure with a YAML file missing format_version. Trace the existing version validation and error handling, then make the missing field produce a proper error instead of KeyError; done means the reported case has a clear error and the relevant checks pass.

Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.

Avaliação

Stack de tecnologia
python
Domínio
data
Tipo de issue
Bug
Dificuldade
2/5
Tempo estimado
1-3 horas
Status de atividade
Estagnada
Clareza
Razoavelmente clara
Facilidade para iniciantes
45/100

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