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Improve error handling in Problem.from_yaml - format_version

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validation
主要語言
Python
星號
18
分支
9
PR 合併指標
30 天內沒有已合併 PR

描述

Missing format_version in the yaml file should provide a proper error message instead of just KeyError:

--> 250 if yaml_config[FORMAT_VERSION] not in {"1", 1, "1.0.0", "2.0.0"}:
    251     raise ValueError("Provided PEtab files are of unsupported version "
    252                      f"{yaml_config[FORMAT_VERSION]}. Expected "
    253                      f"{format_version.__format_version__}.")
    254 if yaml_config[FORMAT_VERSION] == "2.0.0":

KeyError: 'format_version'

貢獻指南

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  1. 先讀完整個 Issue,再讀專案的貢獻指南。
  2. 在 Issue 下留言說明你要接手 —— 這能避免兩個人做同樣的事。
  3. Fork 儲存庫,在一個分支上完成修改。
  4. 送出 Pull Request,並在描述裡引用這個 Issue 編號。

研究方向

Start at the Problem.from_yaml entry point and reproduce the failure with a YAML file missing format_version. Trace the existing version validation and error handling, then make the missing field produce a proper error instead of KeyError; done means the reported case has a clear error and the relevant checks pass.

由索引模型根據 Issue 內容生成。

評估

技術堆疊
python
領域
data
Issue 類型
缺陷
難度
2/5
預估耗時
1-3 小時
活躍度
停滯
描述清晰度
基本清楚
新手友好度
45/100

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