MIT-LCP / MIT-LCP/wfdb-python

The `dl_files` function is giving an error

オープン
#306 コメント 4 件 リアクション 0 件 担当者 0 名 GitHub で見る

まだ誰も着手していません。

主要言語
Jupyter Notebook
スター
853
フォーク
322
PR マージ指標
30日以内にマージされた PR はありません

説明

The wfdb.io.dl_files function is working in older version of python (v3.6) but is failing with the following error in a newer version (3.9.5):

Downloading files...
Traceback (most recent call last):
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/spawn.py", line 125, in _main
    prepare(preparation_data)
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/spawn.py", line 236, in prepare
    _fixup_main_from_path(data['init_main_from_path'])
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/spawn.py", line 287, in _fixup_main_from_path
    main_content = runpy.run_path(main_path,
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/runpy.py", line 268, in run_path
    return _run_module_code(code, init_globals, run_name,
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/runpy.py", line 97, in _run_module_code
    _run_code(code, mod_globals, init_globals,
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/runpy.py", line 87, in _run_code
    exec(code, run_globals)
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/temp_credentialed_download.py", line 5, in <module>
    wfdb.io.dl_files('mitdb','/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/files',['115.dat'])
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/site-packages/wfdb/io/download.py", line 531, in dl_files
    pool = multiprocessing.Pool(processes=2)
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/context.py", line 119, in Pool
    return Pool(processes, initializer, initargs, maxtasksperchild,
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/pool.py", line 212, in __init__
    self._repopulate_pool()
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/pool.py", line 303, in _repopulate_pool
    return self._repopulate_pool_static(self._ctx, self.Process,
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/pool.py", line 326, in _repopulate_pool_static
    w.start()
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/process.py", line 121, in start
    self._popen = self._Popen(self)
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/context.py", line 284, in _Popen
    return Popen(process_obj)
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/popen_spawn_posix.py", line 32, in __init__
    super().__init__(process_obj)
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/popen_fork.py", line 19, in __init__
    self._launch(process_obj)
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/popen_spawn_posix.py", line 42, in _launch
    prep_data = spawn.get_preparation_data(process_obj._name)
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/spawn.py", line 154, in get_preparation_data
    _check_not_importing_main()
  File "/Users/briangow/Documents/MIT/physionet/physionet-build/env/lib/python3.9/multiprocessing/spawn.py", line 134, in _check_not_importing_main
    raise RuntimeError('''
RuntimeError: 
        An attempt has been made to start a new process before the
        current process has finished its bootstrapping phase.
        This probably means that you are not using fork to start your
        child processes and you have forgotten to use the proper idiom
        in the main module:
            if __name__ == '__main__':
                freeze_support()
                ...
        The "freeze_support()" line can be omitted if the program
        is not going to be frozen to produce an executable.
python-BaseException

コントリビューションガイド

このリポジトリのコントリビューションガイドは索引されていません

はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

調査の方向性

traceback は wfdb.io.dl_files と multiprocessing.Pool をエントリーポイントとして特定している。Python 3.9.5 でダウンロードを再現し、関数がどのように worker を起動するかを調査する。同じ dl_files 呼び出しで、multiprocessing の起動エラーなしに要求されたファイルをダウンロードできれば完了。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

評価

技術スタック
python
領域
backend
issue の種類
バグ
難易度
3/5
見積もり時間
1〜2日
活発さ
停滞
明瞭さ
おおむね明確
初心者へのやさしさ
45/100

新しい issue をメールで受け取る

初心者向けの GitHub issue を短くまとめたダイジェスト。