MIT-LCP / MIT-LCP/wfdb-python

Errors in `get_record_list`

未关闭
#304 2 条评论 0 个 reaction 已指派 0 人 在 GitHub 查看

还没有人认领这个 Issue。

主要语言
Jupyter Notebook
星标
853
派生
322
PR 合并指标
30 天内没有已合并 PR

描述

import wfdb
print(wfdb.get_record_list("antimicrobial-resistance-uti")) # The 7th database from get_dbs()

Rather than returning a list of records, it returns a list of lines of a 403 Error HTML file.

['<!DOCTYPE html>', '', '<html lang="en">', ' <head>', ' <meta charset="UTF-8">', ' <title>', '403: Forbidden Access', '</title>', ... , '</html>']

Beyond either removing, renaming or fixing the dbname. I would also recommend detecting that the file accessed is an Error Page and not a valid list of records and raise a corresponding Python Error.

Also:
print(wfdb.get_record_list("bhx-brain-bounding-box")) # The 9th database from get_dbs()

Raises a Value Error:
ValueError: The database https://physionet.org/files/bhx-brain-bounding-box/1.1 has no WFDB files to download

贡献指南

这个仓库没有索引到贡献指南

从这里开始

  1. 先读完整个 Issue,再读项目的贡献指南。
  2. 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
  3. Fork 仓库,在一个分支上完成修改。
  4. 提交 Pull Request,并在描述里引用这个 Issue 编号。

调研方向

从 get_record_list 入口点开始,复现 issue 中的 antimicrobial-resistance-uti 和 bhx-brain-bounding-box 示例。跟踪数据库响应的解析过程,然后验证有效数据库会返回记录名称,而 HTML 错误页面或不包含 WFDB 文件的数据库会产生相应的 Python 错误。

由索引模型根据 Issue 内容生成。

评估

技术栈
python
领域
databases
Issue 类型
缺陷
难度
3/5
预计耗时
1-2 天
活跃度
停滞
描述清晰度
基本清楚
新手友好度
38/100

把新 issue 发到你的邮箱

精选适合新手参与的 GitHub issue 摘要。