MIT-LCP / MIT-LCP/wfdb-python

Errors in `get_record_list`

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Lingua principale
Jupyter Notebook
Stelle
853
Fork
322
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Descrizione

import wfdb
print(wfdb.get_record_list("antimicrobial-resistance-uti")) # The 7th database from get_dbs()

Rather than returning a list of records, it returns a list of lines of a 403 Error HTML file.

['<!DOCTYPE html>', '', '<html lang="en">', ' <head>', ' <meta charset="UTF-8">', ' <title>', '403: Forbidden Access', '</title>', ... , '</html>']

Beyond either removing, renaming or fixing the dbname. I would also recommend detecting that the file accessed is an Error Page and not a valid list of records and raise a corresponding Python Error.

Also:
print(wfdb.get_record_list("bhx-brain-bounding-box")) # The 9th database from get_dbs()

Raises a Value Error:
ValueError: The database https://physionet.org/files/bhx-brain-bounding-box/1.1 has no WFDB files to download

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Inizia dal punto di ingresso get_record_list e riproduci gli esempi antimicrobial-resistance-uti e bhx-brain-bounding-box dell’issue. Traccia il modo in cui viene analizzata la risposta del database, quindi verifica che i database validi restituiscano i nomi dei record, mentre una pagina di errore HTML o un database senza file WFDB produca un errore Python corrispondente.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
python
Ambito
databases
Tipo di issue
Bug
Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Abbastanza chiara
Idoneità per principianti
38/100

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