MIT-LCP / MIT-LCP/wfdb-python

Errors in `get_record_list`

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Vorherrschende Sprache
Jupyter Notebook
Sterne
853
Forks
322
PR-Merge-Kennzahlen
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beschreibung

import wfdb
print(wfdb.get_record_list("antimicrobial-resistance-uti")) # The 7th database from get_dbs()

Rather than returning a list of records, it returns a list of lines of a 403 Error HTML file.

['<!DOCTYPE html>', '', '<html lang="en">', ' <head>', ' <meta charset="UTF-8">', ' <title>', '403: Forbidden Access', '</title>', ... , '</html>']

Beyond either removing, renaming or fixing the dbname. I would also recommend detecting that the file accessed is an Error Page and not a valid list of records and raise a corresponding Python Error.

Also:
print(wfdb.get_record_list("bhx-brain-bounding-box")) # The 9th database from get_dbs()

Raises a Value Error:
ValueError: The database https://physionet.org/files/bhx-brain-bounding-box/1.1 has no WFDB files to download

Beitragsleitfaden

Für dieses Repository ist kein Beitragsleitfaden indexiert

Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Beginne am get_record_list-Einstiegspunkt und reproduziere die Beispiele antimicrobial-resistance-uti und bhx-brain-bounding-box aus dem Issue. Verfolge, wie die Datenbankantwort geparst wird, und überprüfe anschließend, dass gültige Datenbanken Datensatznamen zurückgeben, während eine HTML-Fehlerseite oder eine Datenbank ohne WFDB-Dateien einen entsprechenden Python-Fehler erzeugt.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
python
Bereich
databases
Issue-Typ
Bug
Schwierigkeit
3/5
Geschätzter Aufwand
1-2 Tage
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Größtenteils klar
Anfängerfreundlichkeit
38/100

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