DiamondLightSource/httomo

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High-throughput tomography pipeline

スター: 10
フォーク: 5
オープンの初心者向け issue: 0
索引済み issue: 116
平均マージ: 5日 17時間
マージ済み PR（30日）: 1

主要言語: Python
ライセンス: ライセンスのデータがありません
最終 GitHub push: 2026年8月27日
最新の索引: 2026年9月15日
コントリビューションガイド: コントリビューションガイドがありません
行動規範: 行動規範がありません
初心者向けラベル: 初心者向けラベルは索引されていません

オープンすべて

オープンの issue を 116 件索引しました

Use DAGs ("directed acyclic graphs") to inform the re-running of a pipeline オープン

enhancement

DiamondLightSource/httomo#11 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Verify the number of MPI processes to use for a run before launching a cluster job オープン

enhancement

DiamondLightSource/httomo#52 · コメント 0 件 · リアクション 1 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Document performance of in-memory reslice operation on real data オープン

documentation

DiamondLightSource/httomo#85 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
`sino_360_to_180` method changing data shape breaks GPU loop オープン

bug

DiamondLightSource/httomo#160 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Improve CPU memory efficiency オープン

enhancement framework

DiamondLightSource/httomo#170 · コメント 4 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Move index calculations out of `StandardTomoLoader` オープン

enhancement loader

DiamondLightSource/httomo#208 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Enable `StandardTomoLoader` to load sinogram blocks オープン

enhancement loader

DiamondLightSource/httomo#211 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Add ignoring specific projections feature to `StandardTomoLoader` オープン

enhancement loader

DiamondLightSource/httomo#221 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Update `MonitoringInterface.write_results()` to use an IO protocol rather than `typing.TextIO` オープン

enhancement

DiamondLightSource/httomo#226 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Replace angles length consistency check appropriately オープン

enhancement

DiamondLightSource/httomo#236 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Replace any remaining references to `dataset` with `block` オープン

enhancement

DiamondLightSource/httomo#237 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Check for missing method parameters in pipeline config with YAML checker オープン

enhancement

DiamondLightSource/httomo#241 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Performance benchmarks オープン

DiamondLightSource/httomo#247 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Add tests for YAML generator オープン

testing

DiamondLightSource/httomo#255 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Remove unused `_get_discard_data_out()` function from YAML template generator オープン

enhancement minor

DiamondLightSource/httomo#258 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Don't rely on `output_folder` global variable in YAML generator オープン

minor

DiamondLightSource/httomo#259 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Fix `StandardTomoLoader` not being garbage collected until program termination オープン

bug enhancement loader

DiamondLightSource/httomo#266 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Add checks for obvious incorrect data values in optional debug run オープン

enhancement

DiamondLightSource/httomo#267 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Question about github mechanisms for checking PR readiness before merge オープン

question

DiamondLightSource/httomo#273 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Segfault in `Alltoallv()` operation in reslice オープン

bug enhancement

DiamondLightSource/httomo#274 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Remove unused imports in various python files オープン

minor

DiamondLightSource/httomo#293 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Add loader for loading images オープン

enhancement loader

DiamondLightSource/httomo#295 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Type-hint the data type of numpy/cupy arrays with `np.typing.NDArray` and `cp.typing.NDArray` オープン

enhancement minor

DiamondLightSource/httomo#297 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Based on first method's pattern, infer whether loader should load blocks as projections or sinograms オープン

enhancement loader

DiamondLightSource/httomo#298 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Investigate other means of reporting block processing progress オープン

enhancement

DiamondLightSource/httomo#303 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Debug log message if try/except cupy import fails in `cli.py` オープン

logging minor

DiamondLightSource/httomo#310 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Fix small typo in `_get_middle_slice_indices()` docstring オープン

minor

DiamondLightSource/httomo#312 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月15日に索引
Move pipeline file extension check to YAML checker -> question regarding a generic pipeline checker オープン

question

DiamondLightSource/httomo#313 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Choose a more descriptive parameter name in place of `i` in `UiLayer._append_methods_list()` オープン

minor

DiamondLightSource/httomo#314 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Remove redundant loader check in UI layer オープン

minor

DiamondLightSource/httomo#315 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Choose a more descriptive parameter name in place of `v` in `check_valid_ref_id()` オープン

minor

DiamondLightSource/httomo#316 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Remove any duplication of side output checking between UI layer and YAML checker? オープン

minor question

DiamondLightSource/httomo#317 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
"Refactor nested if" comment, probably referring to `DataSetStoreReader._reslice()` オープン

refactor

DiamondLightSource/httomo#318 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Don't assume cwd is root dir in relative paths in `conftest.py` オープン

minor testing

DiamondLightSource/httomo#320 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Nonexistent method in pipeline YAML causes YAML checker to fail unexpectedly オープン

bug

DiamondLightSource/httomo#331 · コメント 3 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Log absolute path of input data in loader オープン

logging

DiamondLightSource/httomo#337 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Remove unnecessary globbing pattern in package data section of `pyproject.toml` オープン

minor packaging

DiamondLightSource/httomo#342 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Replace redundant globbing in package data section in `pyproject.toml` オープン

minor packaging

DiamondLightSource/httomo#343 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Generate YAML template for `standard_tomo` from new block loader オープン

enhancement loader

DiamondLightSource/httomo#349 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Remove unnecessary dependency of `mpi4py` in `standard_tomo.py` オープン

loader

DiamondLightSource/httomo#350 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Remove `mpi4py` dependency from conda package build config オープン

enhancement packaging

DiamondLightSource/httomo#351 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Templates testing オープン

DiamondLightSource/httomo#370 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Remove unnecessary `pass` in `elif` block `_build_kwargs()` generic wrapper(?) オープン

minor

DiamondLightSource/httomo#374 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Do something with undocumented `pass` in `GenericMethodWrapper._build_kwargs()` オープン

minor

DiamondLightSource/httomo#375 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
YAML checker fails to detect incorrect angles path in loader config オープン

bug

DiamondLightSource/httomo#378 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Sinogram centering method for multiple vertical slices オープン

enhancement

DiamondLightSource/httomo#379 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Add pipeline files with invalid syntax to UI layer tests オープン

testing

DiamondLightSource/httomo#381 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Restructure methods database to avoid redundant information in path オープン

minor

DiamondLightSource/httomo#382 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
OpenMPI setting for saving compressed hdf5 chunks オープン

documentation

DiamondLightSource/httomo#389 · コメント 1 件 · リアクション 1 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引
Unnecessary `workflow_dispatch` in docs github action workflow? オープン

ci question

DiamondLightSource/httomo#391 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月15日に索引

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