Chủ sở hữu
AllenNeuralDynamics
Đã lập chỉ mục 236 kho mã nguồn · Xem trên GitHub
-
aind-ephys-pipeline
AIND pipeline for processing extracellular electrophysiology data
Nextflow · 41 star
-
aind-data-schema
A library that defines AIND data schema and validates JSON.
Python · 34 star
-
openscope-community-predictive-processing
This repository serves as a hub for community-driven contributions, documentation, and project tracking of the OpenScope Predictive Proce...
Python · 26 star
-
aind-ephys-spikesort-kilosort25-full
CodeOcean capsule for full electrophysiology analysis pipeline using Kilosort2.5 via SpikeInterface.
Python · 14 star
-
aind-large-scale-cellpose
Large-scale cell segmentation with cellpose.
Python · 10 star
-
Rhapso
An open-source Python toolkit for large-scale fluorescence microscopy data alignment and fusion.
Python · 9 star
-
dynamic-foraging-task
Bonsai/Harp workflow for Dynamic Foraging with Python GUI for visualization and control
Python · 7 star
-
aind-smartspim-pipeline
Repository that hosts the SmartSPIM pipeline code
Nextflow · 6 star
-
TigerASI
a lightweight python interface for ASI brand Tiger Controllers
Python · 5 star
-
wavpack-numcodecs
Numcodecs implementation of the WavPack audio codec
C · 5 star
-
anivia
Fork of VGG VIA to better support annotation of animal pose images
JavaScript · 4 star
-
harp.device.treadmill-driver
0326: a Harp-compatible device for controlling an instrumented mouse treadmill
Jupyter Notebook · 4 star
-
voxel-classic
General purpose microscope control repository
Python · 4 star
-
view
Model/View for exa-spim
Python · 4 star
-
harp.device.lickety-split
0360: an ephys-compliant capacitive lick detector
C++ · 4 star
-
runze-control
Python Driver for Aurora Pro Scientific (aka Runze Fluid) syringe pumps
Python · 4 star
-
parallax
Automatic detection of probe position from multiple camera views
Python · 4 star
-
aind-SmartSPIM-segmentation
segmentation module for SmartSPIM cloud pipeline
Python · 4 star
-
aind-smartspim-stitch
Stitching and fusion pipeline in the cloud
Python · 4 star
-
aind-smartspim-ccf-registration
Registration of lightsheet whole brain images to the Allen CCF V3 Atlas
Python · 4 star
- Còn 216 kho mã nguồn nữa trên Xem trên GitHub
-
Add segmentation module Đang mởenhancement
AllenNeuralDynamics/lightsheet-compression-tests#4 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
enhancement
AllenNeuralDynamics/python-newscale#2 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/python-newscale#4 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/python-newscale#6 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Unprintable USBxpress exceptions Đang mở
AllenNeuralDynamics/python-newscale#9 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Timeout exception Đang mở
AllenNeuralDynamics/python-newscale#10 · 6 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/spim-core#1 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/spim-core#2 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
joystick axes should be remapped Đang mở
AllenNeuralDynamics/spim-core#5 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/spim-core#21 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/spim-core#22 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/diSpim-UI#24 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Multiscan Ability Đang mở
AllenNeuralDynamics/diSpim-UI#29 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Overview fails when larger area Đang mở
AllenNeuralDynamics/diSpim-UI#32 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#6 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#8 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Check System Memory Đang mởworking_on_it
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#10 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
Python "Class"ification Refactor Đang mởneeds_hardware_test
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#14 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
enhancement
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#17 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#20 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#21 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#25 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Config Validation Đang mở
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#26 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Improved Hardware Agnosticism Đang mởarchitecture
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#27 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#31 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#32 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#33 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#34 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Coherent Genesis Laser Driver Đang mở
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#36 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Log File Quirks Đang mở
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#37 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
Missing Schema Fields Đang mở
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#40 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#47 · 3 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#49 · 2 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#51 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
MIP Process Đang mở
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#52 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#53 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#54 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
Draft Test Folder for tests Đang mở
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#55 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
Reset NIDAQ Đang mở
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#56 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#57 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exa-spim-control#60 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/aind-ephys-spikesort-kilosort25-full#17 · 13 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/aind-ephys-spikesort-kilosort25-full#22 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Postprocessing hangs Đang mở
AllenNeuralDynamics/aind-ephys-spikesort-kilosort25-full#24 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Docker file issue on CodeOcean Đang mởquestion
AllenNeuralDynamics/aind-ephys-spikesort-kilosort25-full#28 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Error using indexing Đang mở
AllenNeuralDynamics/aind-ephys-spikesort-kilosort25-full#29 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Generic way to change spim state Đang mở
AllenNeuralDynamics/exaSpim-UI#1 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exaSpim-UI#4 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
ExaSpim UI Feature Adds Đang mở
AllenNeuralDynamics/exaSpim-UI#5 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenNeuralDynamics/exaSpim-UI#6 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·