AllenNeuralDynamics/biodata-schema

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Complete and accurate metadata for neuroscience

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Lists vs Dictionaries when using `List[Model]` 未关闭

question

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#57 · 13 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Keep a compatibility table for between `schema` and `schema-models` 未关闭

documentation

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#56 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Add Stimulus Epochs to session examples 未关闭

documentation

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#55 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Add slice physiology class to session schema 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#54 · 3 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 2 人 · 索引于 2026年9月13日
Support patch seq experiments in schema 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#53 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Perfusion 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#52 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Revisit photostim class 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#51 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
[2.0] AIND-specific aind-data-schema CO tutorial 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#50 · 3 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 3 人 · 索引于 2026年9月13日
Support multi-subject data 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#49 · 4 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Doc: How do I get alerts on the status of my data 未关闭

documentation

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#48 · 10 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Support for multi-key calibrations 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#47 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Consider aligning the name of scoped properties 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#46 · 3 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Consider adding additonal information from harp-tech whoami device list to generated models 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#45 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Commit linter changes automatically when merging PRs 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#44 · 2 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Replace protocol strings with ProtocolModel 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#43 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Enforce subject_id validation across files 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#42 · 2 条评论 · 1 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
tweaks for Processing example in docs 未关闭

documentation

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#41 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Rename "suffix" to "extension" in write_standard_file 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#40 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
resolve confusing state of Processing schema 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#39 · 5 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Curation.json 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#38 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Validate modality between acquisition data streams and data_description.modalities 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#37 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
restrictions in MouseSubject should be upleveled to the Subject class 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#36 · 2 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
add behavior videos to check modality config 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#35 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Update aind-data-schema dev environment to use uv instead of virtual environments 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#34 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
[v3] Separate device configurations from device properties 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#33 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
[v3] Optional -> required fields 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#32 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Add sectioning.md page with some images describing how to use Sectioning/PlanarSectioning 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#31 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
icephys - config for assembly 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#30 · 7 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Add behavior-only instrument and acquisition examples to /examples 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#29 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Remove TriggerType from Detectors 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#28 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
files.json 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#27 · 2 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Clean up test runner warnings 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#26 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
How to track batches of experiments while affording multi-dimensional asset grouping 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#25 · 7 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Develop class/vocabulary for restrictions 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#24 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 3 人 · 索引于 2026年9月13日
Developmental stage 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#23 · 5 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
create_metadata_json should pull the name from the data_description 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#22 · 3 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
change DataProcess.output_file to allow multiple 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#21 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Move perfusion or add a "terminal_procedure_details" section 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#20 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Enable cross-platform testing in the test matrix 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#19 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
CameraAssembly doesn't support two lens in a macro coupler for ISI Instrument 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#18 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Consider requiring intended_measurement in Channel 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#17 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 0 人 · 索引于 2026年9月13日
Accelerometer placement 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#16 · 2 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Lens implant 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#15 · 1 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 2 人 · 索引于 2026年9月13日
config for 1p imaging 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#14 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 2 人 · 索引于 2026年9月13日
add data_description field to flag non-AIND data 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#13 · 4 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 2 人 · 索引于 2026年9月13日
rename or clarify docstrings on DataDescription.from_xxx methods 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#12 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
deduplication when combining processing/QC records 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#11 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Unnecessary warning about name fields in CoordinatSystem, Software, etc 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#9 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Invalid name survives the derived data name regex 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#7 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日
Intended_depth / Operational_depth 未关闭

AllenNeuralDynamics/biodata-schema#6 · 0 条评论 · 0 个 reaction · 已指派 1 人 · 索引于 2026年9月13日

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