AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis

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compute behavioral metrics and generate basic plottings for the dynamic foraging task

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索引済み issue: 20
平均マージ: 8日 19時間
マージ済み PR（30日）: 1

主要言語: Python
ライセンス: MIT
最終 GitHub push: 2026年9月10日
最新の索引: 2026年9月13日
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Remove dependency on aind_ephys_utils オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#9 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
plot.plot_foraging_session does not operate on dataframes, but rather on lists of events. オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#10 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
annotations.annotate_rewards should ensure that all rewards either have a triggering lick, or are manual/auto water オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#17 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Update streamlit plotly session scroller to use lick annotations オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#18 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Formalize notion of an analysis object オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#23 · コメント 3 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Additional trial by trial metrics to include オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#27 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Add trial by trial metrics to trial-based session plot (plot_foraging_session) オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#28 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
plot_foraging_session treats ignored trials as "left" in choice plot オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#32 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
finish migrating session stats to plot_foraging_session.py オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#34 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
add lick statistics to trial by trial metrics オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#35 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
vertical option in plot_foraging_Session.py doesnt work reliably オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#37 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
add example notebooks オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#38 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
Unbaited task in session scroller shows up as baited オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#41 · コメント 4 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Add FIP channel to interpretable name mapper オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#45 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Add goCue_time or choice_time line to the plot オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#46 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Update plot_fip to be plot_PSTH オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#72 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Factor out all FIP functions to a FIP specific utils repo オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#89 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Add tests for python versions 3.11 to 3.14 オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#93 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Refactor multisession analysis into here オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#94 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Make a plot that shows how the automatic lick spout system was working オープン

AllenNeuralDynamics/aind-dynamic-foraging-basic-analysis#95 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引

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