AllenNeuralDynamics / AllenNeuralDynamics/Aind.Behavior.DynamicForaging

Bias computation does not match v1 bias computation

Đang mở
#134 0 bình luận 0 reaction 1 người được giao Được @micahwoodard nhận Xem trên GitHub
Ngôn ngữ chính
C#
Star
0
Fork
0
Merge trung bình
1 ngày 22 giờ
Pull request đã merge (30 ngày)
21

Mô tả

The bias computation is deterministic, so it should match exactly, but it does not. Its very close, and is likely simply a difference in parameters, but its worth understanding why its not exact in case there is a deeper misunderstanding

In the following plot, I'm plotting the bias computed by the refactor acquisition code, as well as bias computed post-hoc by our analysis tools. The analysis tool computation matches exactly with how the v1 implementation acquisition code computed bias.

- Note the v1 version computes the bias every 10 trials and then backfills. So what we are looking for is the right-side of each v1 value to match the refactor bias, but it does not match.
- key parameters:
- n_trials_back = 5
- max_window = 200
- cv = 1
- compute_every = 10 # this is 1 for the refactor, and that should be fine

Image

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.