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AllenCell
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vole-core
core rendering canvas and data loading services for Vol-E volume viewer
TypeScript · スター 106 個
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agave
High quality visualization for volumetric image data
C++ · スター 62 個
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Python · スター 32 個
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aics-segmentation
Part 1 of Allen Cell and Structure Segmenter: classic image segmentation workflow
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cvapipe_analysis
Analysis of data produced by cvapipe for the variance paper
Jupyter Notebook · スター 24 個
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Python · スター 24 個
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napari-allencell-segmenter
A plugin that enables image segmentation provided by Allen Institute for Cell Science
Python · スター 20 個
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segmenter_model_zoo
scripts and API for running Deep Learning models from segmenter
Jupyter Notebook · スター 10 個
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Python · スター 7 個
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benchmarking_representations
Benchmarking different methods for extracting unsupervised representations from images
Python · スター 7 個
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allencell-segmenter-ml
Napari plugin for ml segmentation
Python · スター 5 個
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endothelial-pipeline
Dynamics of ML-based morphological features indicate a shear stress-dependent bifurcation of hiPSC-derived endothelial cell states
Python · スター 2 個
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cell-feature-explorer
Plot and explore data that is linked to images, with an embedded viewer
TypeScript · スター 2 個
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EMT_data_analysis
This repo contains code for EMT deliverable data analysis and has dependencies associated with output from EMT_image_analysis repo.
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Python · スター 0 個
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camera-alignment-core
Core algorithms for alignment of two-camera microscopy imagery
Python · スター 0 個
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cellpack-client
Frontend interface for cellPACK
TypeScript · スター 0 個
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cell-catalog
Cell catalog 2.0
TypeScript · スター 0 個
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TypeScript · スター 0 個
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Refactor pass 1 オープンengine enhancement segmenter UI
AllenCell/napari-allencell-segmenter#68 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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engine enhancement
AllenCell/napari-allencell-segmenter#100 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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engine enhancement needs grooming UI
AllenCell/napari-allencell-segmenter#106 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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bug
AllenCell/napari-allencell-segmenter#124 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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Custom workflows オープンengine enhancement needs grooming segmenter UI
AllenCell/napari-allencell-segmenter#127 · コメント 3 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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engine enhancement
AllenCell/napari-allencell-segmenter#132 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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AllenCell/napari-allencell-segmenter#144 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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AllenCell/napari-allencell-segmenter#154 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/napari-allencell-segmenter#155 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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bug
AllenCell/napari-allencell-segmenter#156 · コメント 6 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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bug
AllenCell/napari-allencell-segmenter#157 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/napari-allencell-segmenter#160 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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Pytests do not run オープン
AllenCell/napari-allencell-segmenter#161 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/napari-allencell-segmenter#162 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/napari-allencell-segmenter#163 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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bug
AllenCell/napari-allencell-segmenter#165 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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bug
AllenCell/napari-allencell-segmenter#166 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/nuc-morph-analysis#64 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/camera-alignment-core#22 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/camera-alignment-core#24 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/camera-alignment-core#30 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/camera-alignment-core#34 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/camera-alignment-core#36 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/EMT_data_analysis#29 · コメント 3 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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AllenCell/EMT_data_analysis#37 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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AllenCell/EMT_data_analysis#38 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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AllenCell/EMT_data_analysis#39 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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AllenCell/EMT_data_analysis#40 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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AllenCell/EMT_data_analysis#41 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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Add DiffAE to tests オープン
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Upgrade Pytorch オープン
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AllenCell/cell-feature-explorer#107 · コメント 1 件 · リアクション 1 件 · 担当者 0 名 ·
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good first issue
AllenCell/cell-feature-explorer#110 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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bug
AllenCell/cell-feature-explorer#114 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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enhancement ux
AllenCell/cell-feature-explorer#124 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/cell-feature-explorer#125 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/cell-feature-explorer#126 · コメント 3 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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AllenCell/cell-feature-explorer#134 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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ux
AllenCell/cell-feature-explorer#135 · コメント 4 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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Tech debt
AllenCell/cell-feature-explorer#139 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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Enable Zarr download オープンux
AllenCell/cell-feature-explorer#141 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 2 名 ·