AllenCell / AllenCell/camera-alignment-core

Generated OME-TIFFs must be saved with relevant embedded microscopy metadata

Đang mở
#24 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub
Ngôn ngữ chính
Python
Star
0
Fork
1
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

## Description
Alignment output is saved as an OME-TIFF, but there is no effort to ensure that the embedded metadata contained within the source microscopy imagery is copied into the OME-TIFF.

This needs to be audited and fixed.
- Generation of aligned optical control image: https://github.com/aics-int/camera-alignment-core/blob/main/camera_alignment_core/align.py#L160-L165
- Generate of aligned scenes from image: https://github.com/aics-int/camera-alignment-core/blob/main/camera_alignment_core/align.py#L260-L265

## Expected Behavior
*What did you expect to happen instead?*
All? Some? Most? embedded metadata from source image needs to be saved within the aligned output. Doubtful anyone can provide a complete list of what needs to be present, but, this needs to be best-effort.

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.