AllenCell/allencell-segmenter-ml

Xem trên GitHub

Napari plugin for ml segmentation

Star: 5
Fork: 3
Issue cho người mới đang mở: 0
Issue đã lập chỉ mục: 171

Ngôn ngữ chính: Python
Giấy phép: Không có dữ liệu giấy phép
Lần push lên GitHub gần nhất: 22/9/2025
Lập chỉ mục gần nhất: 13/9/2026
Hướng dẫn đóng góp: Không có hướng dẫn đóng góp
Quy tắc ứng xử: Không có quy tắc ứng xử
Label cho người mới: Chưa lập chỉ mục label nào cho người mới
Chỉ số merge pull request: Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Đang mở Tất cả

Đã lập chỉ mục 171 issue

V2 _ Change popup modal for home directory to main screen Đang mở

UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#297 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Error reporting from training thread Đang mở

🚨 high priority🚨 refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#305 · 2 bình luận · 0 reaction · 2 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Training/Prediction Demo Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#309 · 2 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Suggest predefined patch sizes Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#312 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Only enable next button when current is also finished Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#314 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Refactor training: check user inputs right after train_btn pressed Đang mở

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#315 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Viewer DS optimization Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#316 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
View mapping in curation widget Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#319 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Make curation service testable Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#320 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Investigate radio button behavior and best practices Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#321 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
User defined Patch Sizes Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#322 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Viewer image naming utils class Đang mở

low priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#323 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Change training to use NapariThreadTaskExecutor instead of ChannelExtractionThread. Đang mở

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#331 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
[training] Remove spatial dims selection. Display to user and update UI when we know the spatial dims of their dataset Đang mở

low priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#333 · 0 bình luận · 0 reaction · 2 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
(Tentative) Deprecate image loader Đang mở

refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#335 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Finish input view tests Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#338 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Create a way for the user to change their home directory Đang mở

low priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#341 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
General: what happen after a crash? Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#345 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Main screen: what happens if a user accidentally names their new model the same name as an existing one? Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#346 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Set up PyPI trusted publisher Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#362 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
[curation] [multi-channel support] Only load selected channels during curation image loading Đang mở

needs prioritization

AllenCell/allencell-segmenter-ml#365 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
All segmentations need to be dispayed as label layer Đang mở

needs prioritization

AllenCell/allencell-segmenter-ml#366 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
[1.1]create function to copy state dict for model weights Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#367 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
[1.1] give user option to select an existing model to pull weights from Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#368 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
[1.2] test megaseg and models trained on other systems Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#369 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
[1.2] set up s3 bucket to host megaseg Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#370 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
prediction channel selection fix Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#371 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Multi-channel segmentations Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#374 · 2 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Display progress during first epoch Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#379 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Display loss metrics during training Đang mở

medium priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#380 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Enforce no timeseries images for curation/training/prediction Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#381 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Allow timeseries via config Đang mở

needs prioritization

AllenCell/allencell-segmenter-ml#382 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
disable save csv button initially Đang mở

AllenCell/allencell-segmenter-ml#383 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Curation config / channel selection persistence Đang mở

medium priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#386 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
General refactor to align with curation Đang mở

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#389 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Lint for type hints Đang mở

low priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#390 · 2 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Prediction inputs need to be directories only Đang mở

bug

AllenCell/allencell-segmenter-ml#394 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
No feedback when channel extraction fails Đang mở

bug

AllenCell/allencell-segmenter-ml#395 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Refactor: use built-in types as annotations where available Đang mở

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#399 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Auto-load csv when switching from curation to training Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#400 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
multiple segmentations on curation should be displayed as different colors Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#401 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Images loaded during curation should not be visible during training/prediction. Đang mở

🚨 high priority🚨 bug

AllenCell/allencell-segmenter-ml#402 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Refactor state management for main tabs Đang mở

refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#404 · 0 bình luận · 0 reaction · 3 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
[1.2] Allow model downloads from s3 bucket Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#411 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Bug: invalid literal for int() with base 10: '' Đang mở

🚨 high priority🚨 bug

AllenCell/allencell-segmenter-ml#424 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Method for releasing tag to PyPI Đang mở

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#425 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Warning when dependencies change on release Đang mở

low priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#426 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
Training service tests Đang mở

medium priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#430 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
UI/UX: Styling: Update buttons' color Đang mở

🚨 high priority🚨 UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#432 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026
UI/UX: Spacing Đang mở

🚨 high priority🚨 UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#433 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao · Lập chỉ mục 13/9/2026

AllenCell/allencell-segmenter-ml

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn