AllenCell / AllenCell/allencell-segmenter-ml

Training/Prediction Demo

Đang mở
#309 2 bình luận 0 reaction 1 người được giao Được @amilworks nhận Xem trên GitHub
Ngôn ngữ chính
Python
Star
5
Fork
3
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

We want to be able to demo the plugin at a friday meeting, either on 5/17 or 5/24.
@benjijamorris has already fine-tuned some parameters for the variance dataset, and has been able to achieve good segmentation results through the API.

We need to be able prove we can replicate that through the plugin on a windows workstation. This is what we need for the demo:

1. Models trained through the plugin that are able to give good segmentation results. We need good models for multiple (2+) variance datasets.
2. demo of models doing prediction, either through screen captured video or live.
3. parameters used to train the models, for reproducibility.

We have a windows workstation ready for @amilworks, and you could start by testing version `0.1.1.dev0` on artifactory (available w/ `pip install --index-url https://artifactory.corp.alleninstitute.org/artifactory/api/pypi/pypi-virtual/simple allencell-ml-segmenter==0.1.1.dev0` while connected to vpn). We'll release another version later in the week with user-defined patch sizes which we can install when ready.

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.