mimic3wdb-matched RECORDS file hast too many entries

未关闭

#466 创建于 2023年9月22日 1 条评论 0 个 reaction 已指派 0 人在 GitHub 查看

还没有人认领这个 Issue。

评估

难度: 4/5
预计耗时: 3-5 天
新手友好度: 35/100

Issue 类型: 缺陷
描述清晰度: 基本清楚
活跃度: 停滞
技术栈: python
领域: backend, data

调研方向

从 wfdb.io.dl_database 开始，将链接的 mimic3wdb-matched RECORDS 文件与数据库内容进行比较，包括缺失的 3783537_10000.hea URL。确认额外条目如何导致下载失败，然后验证下载数据库时不再请求不存在的记录；拟议的多线程更改是一个独立且范围更广的问题。

由索引模型根据 Issue 内容生成。

描述

We are trying to download the mimic3wdb-matched database via wfdb.io.dl_database like so:

wfdb.io.dl_database("mimic3wdb-matched", "mimic3wdb-matched", records='all', annotators='all', keep_subdirs=True, overwrite=False)

After a long wait, we get an error indicating a missing file:
wfdb.io._url.NetFileNotFoundError: 404 Error: Not Found for url: https://physionet.org/files/mimic3wdb-matched/1.0/p01/p017488/3783537_10000.hea

While investigating we found that the corresponding RECORDS file contains more records than there are in the database:
https://physionet.org/files/mimic3wdb-matched/1.0/p01/p017488/RECORDS

RECORDS file:

Actual content:

wfdb.io.dl_database generates unique urls using this RECORDS file which then leads to the mentioned error above.

Some questions:

Can someone adapt the RECORDS file to reflect the database content
The download via wfdb.io.dl_database is excruciating slow. Would it make sens to rewrite wfdb.io.dl_database to use multi-threading? Or what approach do you use to dump the whole database efficiently?

主要语言: Jupyter Notebook
星标: 853
派生: 322
PR 合并指标: 30 天内没有已合并 PR

贡献指南

这个仓库没有索引到贡献指南

从这里开始

先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。

MIT-LCP/wfdb-python 的其他 Issue

Authentication handling in wfdb.io.dl_files, error 403 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 45/100

MIT-LCP/wfdb-python#568 · 2026年5月6日创建
Add validation of segments when writing a `MultiRecord` 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 48/100

MIT-LCP/wfdb-python#557 · 2026年1月9日创建
wfdb.io.MultiRecord.wrsamp missing option for expanded=True 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 58/100

MIT-LCP/wfdb-python#554 · 2026年1月7日创建
WFDB path ignored 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

MIT-LCP/wfdb-python#545 · 2025年7月1日创建
Add support for single-file record packaging (`.wfdb`) 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 30/100

MIT-LCP/wfdb-python#540 · 2025年4月28日创建

查看 MIT-LCP/wfdb-python 的全部 Issue

相似的 Issue

[Perf]: the capability epoch counts archived skills, so archiving one rebuilds every Bot Chat's system prompt 未关闭

area/sessions comp/agent P2 tool/skills type/perf

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 82/100

NousResearch/hermes-agent#117788 · 2026年9月21日创建
[Bug] [Connector-V2] [Http] A streaming Http source never completes a checkpoint: poll_interval_millis is waited out holding the checkpoint lock 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 78/100

apache/seatunnel#12411 · 2026年9月20日创建
wafv2: TagResource/UntagResource don't enforce the 50-tag limit or key/value length limits 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 76/100

floci-io/floci#4035 · 2026年9月20日创建
[Duplicate Code] Repeated filtered model-alias assembly in proxy server 未关闭

code-quality refactoring

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 84/100

github/gh-aw-firewall#8816 · 2026年9月20日创建
popularity.exclude_admin does not work for admin2 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 68/100

getgrav/grav-plugin-api#45 · 2026年9月20日创建

更多 Backend & API Design Issue