Daemon mode mypy checks way more files the second time with the same command run

Bug Report

Daemon mode mypy takes a long time to check the same file with no modifications done

To Reproduce

git clone https://github.com/Ryang20718/mypy-repro
cd mypy-repro
python3 -m venv .venv
pip install -r requirements.txt
dmypy run example/c.py
dmypy run example/c.py

Expected Behavior

I'd expect dmypy to report no issues both times, but it hangs the second time

Actual Behavior

based on the timing file, we see time spent on numpy

(.venv)mypyrepro ryang$ dmypy run example/c.py 
Daemon started
Success: no issues found in 1 source file
(.venv) mypyrepro ryang$ dmypy run example/c.py 
Success: no issues found in 1087 source files

Your Environment

• Mypy version used: 1.10.0
• Mypy command-line flags: dmypy run example/c.py
• Mypy configuration options from mypy.ini https://github.com/Ryang20718/mypy-repro/blob/main/.mypy.ini
• Python version used: 3.10

Riproduci il problema con il virtualenv e il mypy.ini elencati e con i comandi dmypy run example/c.py ripetuti. Confronta la prima e la seconda esecuzione, includendo il file dei tempi e i controlli imprevisti di numpy, quindi traccia il lavoro incrementale del daemon. Il lavoro è completato quando il secondo comando, invariato, controlla solo il file richiesto e restituisce il risultato previsto senza il lungo ritardo.