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graph_objs.volume and .isosurface not rendering non-cuboid

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Beschreibung

I'm trying to use plotly in a dash app to render a cuboid, that's sheared to the y-axis.=it has a parallelogram as ground surface. It consists of individual points, each with a density value. plotly_express.scatter_3d renders the individual points correctly, but only has "2 views" when rotating it:

  • One where the closest face is rendered
  • -> you can't look inside very well
  • One where both the closest face and the inside of the structure are not rendered
  • -> you can only see the 2 rear side faces, but from the inside

With both, I'm losing a lot of information on the insides of my structure.
I think scatter_3d doesn't allow for

  • a) all points to stay rendered at all times
  • b) me to link each individual points opacity to its density value (like it does with color)¹

Best looking solution would be graph_objs.Volume or .isosurface, but they have an issue.

So far, the coordinates data had to be arranged to form an orthogonal cuboid, to render a volume.
My test data is not the same y-sheared cuboid I want to achieve, but it illustrates the issue of both graph_objs.

Test Data:
Using plotly_express.scatter_3d() for comparison, the following dataframe shows both Figures rendering the expected result:

DF = pd.DataFrame(data={
    'x': [0, 0, 0, 0, 0, 0, 1,1,1,1,1,1],
    'y': [0,0,0,1,1,1,0,0,0,1,1,1],
    'z': [0,1,2,0,1,2,0,1,2,0,1,2],
    'val': [1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1]})

scatter plot:
points

volume plot:
points volume

When removing 2 points at (0/1/2) & (1/1/2) -

DF = pd.DataFrame(data={
    'x': [0, 0, 0, 0, 0, 1,1,1,1,1],
    'y': [0,0,0,1,1,0,0,0,1,1],
    'z': [0,1,2,0,1,0,1,2,0,1],
    'val': [1,1,1,1,1,1,1,1,1,1]})
  • go.Volume breaks.

scatter plot:
scattermissing

volume plot:
vol missing

scatter_3d figure:

px.scatter_3d(
    DF,
    x='x',
    y='y',
    z='z',
    color='val',
    opacity=0.5,
    color_continuous_scale=px.colors.sequential.Inferno_r,
    range_color=[df.min()['val'], df.max()['val']],
    template=templ)

opacity doesn't take lists/ranges, so I can't use DF.val there.

Volume figure:

go.Figure(data=go.Volume(
    x=DF.x,
    y=DF.y,
    z=DF.z,
    value=DF.val,
    opacity=0.3,
    surface_count=17,
    colorscale=px.colors.sequential.Inferno_r
))

I played around with surface_count, but it doesn't seem to be causing the problem.

My 2 points being:

  • go.Volume/.isosurface don't work if angles of !=90° are involved
  • px.scatter_3d deserves some more configuration-options, especially opacity-wise

Beitragsleitfaden

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Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Die bereitgestellten Beispiele für plotly_express.scatter_3d und go.Volume reproduzieren, einschließlich der vollständigen Datensätze und der Datensätze mit fehlenden Punkten. Mit den Einstiegspunkten go.Volume und go.Isosurface beginnen und ihr Verhalten bei gescherten Koordinaten und fehlenden Punkten vergleichen. Done sollte feststellen, ob diese Eingaben unterstützt werden, und die beobachtete Einschränkung bei der Darstellung beheben oder eindeutig dokumentieren.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
python
Bereich
data-visualization
Issue-Typ
Bug
Schwierigkeit
4/5
Geschätzter Aufwand
3-5 Tage
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Größtenteils klar
Anfängerfreundlichkeit
35/100

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