plotly / plotly/plotly.py

Pandas import error

Đang mở
#2,433 10 bình luận 2 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

bug P3
Ngôn ngữ chính
Python
Star
18.8k
Fork
2.8k
Merge trung bình
16 giờ 26 phút
Pull request đã merge (30 ngày)
21

Mô tả

A Dash user is seeing an error from pandas without ever directly importing pandas, just dash, plotly, and numpy. https://community.plotly.com/t/callback-error-when-plotting-multiple-graph-objects/38756

The error occurs inside plotly when the Dash app tries to render one of the plots in a callback:

Traceback (most recent call last):
  File "/Users/alex/plotly/fiddle/f.py", line 74, in update_dist_plot
    "data": [go.Bar(x=bins, y=counts)],
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/lib/python3.7/site-packages/plotly/graph_objs/__init__.py", line 93149, in __init__
    self["x"] = x if x is not None else _v
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/lib/python3.7/site-packages/plotly/basedatatypes.py", line 3490, in __setitem__
    self._set_prop(prop, value)
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/lib/python3.7/site-packages/plotly/basedatatypes.py", line 3772, in _set_prop
    val = validator.validate_coerce(val)
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/lib/python3.7/site-packages/_plotly_utils/basevalidators.py", line 385, in validate_coerce
    v = copy_to_readonly_numpy_array(v)
  File "/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.7/lib/python3.7/site-packages/_plotly_utils/basevalidators.py", line 93, in copy_to_readonly_numpy_array
    if pd and isinstance(v, (pd.Series, pd.Index)):
AttributeError: module 'pandas' has no attribute 'Series'

That's the error I see - the OP's error message is a little more extensive, which is a little funny because we both report pandas v1.0.3

AttributeError: partially initialized module ‘pandas’ has no attribute ‘Series’ (most likely due to a circular import)

I can reproduce locally with this app:

import dash_core_components as dcc
import dash_html_components as html
from dash import Dash
from dash.dependencies import Input, Output
import plotly.graph_objs as go
import numpy as np

app = Dash(__name__)

app.layout = html.Div(
    [
        html.Div(
            [
                html.Br(),
                html.Label("Plotting Options"),
                dcc.RadioItems(
                    id="trunk-angle-radio",
                    options=[
                        {"label": "Sagittal", "value": "Sagittal"},
                        {"label": "Lateral", "value": "Lateral"},
                        {"label": "Twist", "value": "Twist"},
                    ],
                    value="Sagittal",
                ),
            ]
        ),
        html.Div(
            [
                html.Div(
                    [dcc.Graph(id="trunk-angle-plot")],
                    style={"width": "48%", "display": "inline-block"},
                ),
                html.Div(
                    [dcc.Graph(id="trunk-angle-dist")],
                    style={"width": "48%", "display": "inline-block", "float": "right"},
                ),
            ]
        ),
        html.Div(
            [
                html.Label("Data Statistics"),
                html.Div(id="data-stats-div", style={"padding": 10}),
            ]
        ),
    ]
)


@app.callback(
    Output("trunk-angle-plot", "figure"), [Input("trunk-angle-radio", "value")]
)
def update_angle_plot(radio_option):
    (x, y) = get_trunk_angles(radio_option)
    fig = {
        "data": [go.Scatter(x=x, y=y, mode="lines+markers")],
        "layout": go.Layout(
            title="Trunk Angle Time Series Plot",
            xaxis={"title": "Time (sec)"},
            yaxis={"title": "Degrees"},
        ),
    }
    return fig


@app.callback(
    Output("trunk-angle-dist", "figure"), [Input("trunk-angle-radio", "value")]
)
def update_dist_plot(radio_option):
    (x, y) = get_trunk_angles(radio_option)
    counts, bins = np.histogram(y, bins=range(-90, 91, 30))
    bins = bins + (bins[1] - bins[0]) / 2
    # print(counts, bins)
    fig = {
        "data": [go.Bar(x=bins, y=counts)],
        "layout": go.Layout(
            title="Trunk Angle Distributions",
            xaxis={
                "title": "Bin midpoint (degrees)",
                "tickmode": "array",
                "tickvals": bins,
                "ticktext": [str(int(bin)) for bin in bins],
            },
            yaxis={"title": "Percentage of time"},
        ),
    }
    return fig


@app.callback(
    Output("data-stats-div", "children"), [Input("trunk-angle-radio", "value")]
)
def update_stats(radio_option):
    (x, y) = get_trunk_angles(radio_option)
    stats_div = [
        html.Div("Minimum: {}".format(np.min(y)), id="trunk-angle-dist-min"),
        html.Div("Maximum: {}".format(np.max(y)), id="trunk-angle-dist-max"),
        html.Div("Mean: {:.2f}".format(np.mean(y)), id="trunk-angle-dist-mean"),
        html.Div(
            "Standard Deviation: {:.2f}".format(np.std(y)), id="trunk-angle-dist-std"
        ),
        html.Div(
            "Range: {}".format(np.max(y) - np.min(y)), id="trunk-angle-dist-range"
        ),
    ]
    return stats_div


def get_trunk_angles(radio_option):

    dummy_x = np.linspace(0, 50, 101)

    if radio_option == "Sagittal":
        dummy_y = np.random.randint(-90, 90, 101)
    elif radio_option == "Lateral":
        dummy_y = np.random.randint(-90, 90, 101)
    elif radio_option == "Twist":
        dummy_y = np.random.randint(-90, 90, 101)

    return (dummy_x, dummy_y)


if __name__ == "__main__":
    app.run_server(debug=True)

Hướng dẫn đóng góp

Mở hướng dẫn đóng góp

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Hướng nghiên cứu

Tái hiện ứng dụng Dash được cung cấp và bắt đầu từ các vị trí traceback trong plotly/basedatatypes.py và _plotly_utils/basevalidators.py, đặc biệt là update_dist_plot và copy_to_readonly_numpy_array. Truy tìm lý do pandas thiếu Series trong quá trình xây dựng go.Bar, sau đó xác minh rằng callback được render mà không có AttributeError đã nêu.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Đánh giá

Công nghệ
numpy, pandas, python
Lĩnh vực
data-visualization
Loại issue
Lỗi
Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Độ rõ ràng
Cần làm rõ
Mức phù hợp với người mới
25/100

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.