plotly / plotly/plotly.py

Add continuous color scale to strip, box, and violin plots

Offen
#1,938 22 Kommentare 6 Reaktionen 0 zugewiesene Personen Auf GitHub ansehen

Dieses Issue hat noch niemand übernommen.

feature P3
Vorherrschende Sprache
Python
Sterne
18.8k
Forks
2.8k
Ø Merge
16 Std. 26 Min.
Gemergte PRs (30 T.)
21

Beschreibung

Currently, strip/box/violin plots only work with categorical/discrete colormaps. This is sufficient for the violins and boxes but for the points that can be included in all three plots, it would be useful to color by a continuous feature and to add a colorbar to the plot. I looked around a bit and it seems like the go.Box constructor needs to have the coloraxis attrbute added to it (and I suspect something would need to be added to avoid coloring the boxes/violins in the same colors as the points, since they are colored the same for categorical variables).

The example below illustrates the issue by trying to color by the sepal_width variable:

import plotly.express as px

iris = px.data.iris()
px.strip(iris, 'species', 'sepal_length', 'sepal_width', stripmode='overlay')

image

The resulting plot is not meaningful since it colors a continuous variable with a discrete colormap.

So far, I have not found a prettier workaround that this (which is imperfect since it uses the legend instead of a colorbar):

import matplotlib as mpl

sw = iris['sepal_width'].sort_values()
sw_01 = (sw - sw.min()) / (sw.max() - sw.min())
sw_colors = {n: mpl.colors.rgb2hex(c) for n, c in zip(sw, mpl.cm.viridis(sw_01))}
px.strip(iris, 'species', 'sepal_length', 'sepal_width',
         stripmode='overlay', category_orders={'sepal_width': sw.to_list()[::-1]},
         color_discrete_map=sw_colors)

image

Beitragsleitfaden

Beitragsleitfaden öffnen

Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Beginne mit px.strip und dem go.Box-Konstruktor und konzentriere dich darauf, wie die Plots strip, box und violin derzeit mit kategorialen Farben umgehen. Reproduziere das iris-Beispiel mit sepal_width als Farbmerkmal und verfolge anschließend, wie das coloraxis-Attribut und die Plot colorbar zusammengestellt werden. Als erledigt gilt, wenn kontinuierliche Farbgebung und eine colorbar für die enthaltenen Punkte funktionieren, ohne die Punktfarben fälschlicherweise auf die Boxen oder Violinen anzuwenden.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
python
Bereich
data-visualization
Issue-Typ
Feature
Schwierigkeit
4/5
Geschätzter Aufwand
3-5 Tage
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Größtenteils klar
Anfängerfreundlichkeit
35/100

Neue Issues direkt in Ihr Postfach

Eine kurze Übersicht über anfängerfreundliche GitHub-Issues.