Bubble sizes out of order, when using a formula for the `color`/`name` attributes
Đang mở
Chưa có ai nhận issue này.
- Ngôn ngữ chính
- R
- Star
- 2.7k
- Fork
- 641
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Mô tả
Hi folks, I'm seeing a strange effect on scatter plot marker sizes, when using a formula for the color (and name) attributes.
(edited to add more test cases)
library(plotly)
#> Loading required package: ggplot2
#>
#> Attaching package: 'plotly'
#> The following object is masked from 'package:ggplot2':
#>
#> last_plot
#> The following object is masked from 'package:stats':
#>
#> filter
#> The following object is masked from 'package:graphics':
#>
#> layout
df <- data.frame(x = c(1, 2, 3, 4, 5),
y = c(1, 2, 3, 4, 5),
z = c(1, 2, 3, 4, 5))
# Expected output: marker sizes in order
plot_ly(df,
x = ~x,
y = ~y,
type = "scatter",
mode = "markers",
marker = list(size = ~z,
sizeref = 0.1),
color = ~z < 2,
colors = c(I("green"), I("red")),
text = ~paste0("z: ", z))
# df has correct data
df
#> x y z
#> 1 1 1 1
#> 2 2 2 2
#> 3 3 3 3
#> 4 4 4 4
#> 5 5 5 5
# Buggy output: changing "color" formula threshold puts marker sizes out of order
plot_ly(df,
x = ~x,
y = ~y,
type = "scatter",
mode = "markers",
marker = list(size = ~z,
sizeref = 0.1),
color = ~z < 3,
colors = c(I("green"), I("red")),
text = ~paste0("z: ", z))
# df still has correct data
df
#> x y z
#> 1 1 1 1
#> 2 2 2 2
#> 3 3 3 3
#> 4 4 4 4
#> 5 5 5 5
# Buggy output: static vector also puts marker sizes out of order
plot_ly(df,
x = ~x,
y = ~y,
type = "scatter",
mode = "markers",
marker = list(size = ~z,
sizeref = 0.1),
color = c(TRUE, TRUE, FALSE, FALSE, FALSE),
colors = c(I("green"), I("red")),
text = ~paste0("z: ", z))
# Buggy output: use ifelse with (TRUE, FALSE)
plot_ly(df,
x = ~x,
y = ~y,
type = "scatter",
mode = "markers",
marker = list(size = ~z,
sizeref = 0.1),
color = ~ifelse(z < 3, TRUE, FALSE),
colors = c(I("green"), I("red")),
text = ~paste0("z: ", z))
# Possible workaround: use ifelse with (1, 0)
plot_ly(df,
x = ~x,
y = ~y,
type = "scatter",
mode = "markers",
marker = list(size = ~z,
sizeref = 0.1),
color = ~ifelse(z < 3, 1, 0),
colors = c(I("green"), I("red")),
text = ~paste0("z: ", z))
# Buggy again when adding "name" field with formula
plot_ly(df,
x = ~x,
y = ~y,
type = "scatter",
mode = "markers",
marker = list(size = ~z,
sizeref = 0.1),
color = ~ifelse(z < 3, 1, 0),
colors = c(I("green"), I("red")),
name = ~ifelse(z < 3, "Red", "Green"),
text = ~paste0("z: ", z))
Created on 2024-04-06 with reprex v2.1.0
Session info
sessioninfo::session_info()
#> ─ Session info ───────────────────────────────────────────────────────────────
#> setting value
#> version R version 4.3.3 (2024-02-29)
#> os Ubuntu 22.04.4 LTS
#> system x86_64, linux-gnu
#> ui X11
#> language (EN)
#> collate en_US.UTF-8
#> ctype en_US.UTF-8
#> tz America/Indiana/Vevay
#> date 2024-04-06
#> pandoc 3.1.1 @ /usr/lib/rstudio/resources/app/bin/quarto/bin/tools/ (via rmarkdown)
#>
#> ─ Packages ───────────────────────────────────────────────────────────────────
#> package * version date (UTC) lib source
#> callr 3.7.5 2024-02-19 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> cli 3.6.2 2023-12-11 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> colorspace 2.1-0 2023-01-23 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> crosstalk 1.2.1 2023-11-23 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> curl 5.2.0 2023-12-08 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> data.table 1.15.0 2024-01-30 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> digest 0.6.34 2024-01-11 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> dplyr 1.1.4 2023-11-17 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> ellipsis 0.3.2 2021-04-29 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> evaluate 0.23 2023-11-01 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> fansi 1.0.6 2023-12-08 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> farver 2.1.1 2022-07-06 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> fastmap 1.1.1 2023-02-24 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> fs 1.6.3 2023-07-20 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> generics 0.1.3 2022-07-05 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> ggplot2 * 3.5.0 2024-02-23 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> glue 1.7.0 2024-01-09 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> gtable 0.3.4 2023-08-21 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> highr 0.10 2022-12-22 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> htmltools 0.5.7 2023-11-03 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> htmlwidgets 1.6.4 2023-12-06 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> httr 1.4.7 2023-08-15 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> jsonlite 1.8.8 2023-12-04 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> knitr 1.45 2023-10-30 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> lazyeval 0.2.2 2019-03-15 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> lifecycle 1.0.4 2023-11-07 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> magrittr 2.0.3 2022-03-30 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> munsell 0.5.0 2018-06-12 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> pillar 1.9.0 2023-03-22 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> pkgconfig 2.0.3 2019-09-22 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> plotly * 4.10.4 2024-01-13 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> processx 3.8.3 2023-12-10 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> ps 1.7.6 2024-01-18 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> purrr 1.0.2 2023-08-10 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> R.cache 0.16.0 2022-07-21 [1] CRAN (R 4.3.1)
#> R.methodsS3 1.8.2 2022-06-13 [1] CRAN (R 4.3.1)
#> R.oo 1.26.0 2024-01-24 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> R.utils 2.12.3 2023-11-18 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> R6 2.5.1 2021-08-19 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> reprex 2.1.0 2024-01-11 [1] CRAN (R 4.3.3)
#> rlang 1.1.3 2024-01-10 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> rmarkdown 2.25 2023-09-18 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> rstudioapi 0.15.0 2023-07-07 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> scales 1.3.0 2023-11-28 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> sessioninfo 1.2.2 2021-12-06 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> styler 1.10.2 2023-08-29 [1] CRAN (R 4.3.1)
#> tibble 3.2.1 2023-03-20 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> tidyr 1.3.1 2024-01-24 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> tidyselect 1.2.0 2022-10-10 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> utf8 1.2.4 2023-10-22 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> vctrs 0.6.5 2023-12-01 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> viridisLite 0.4.2 2023-05-02 [1] CRAN (R 4.3.0)
#> webshot 0.5.5 2023-06-26 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> withr 3.0.0 2024-01-16 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> xfun 0.42 2024-02-08 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> xml2 1.3.6 2023-12-04 [1] CRAN (R 4.3.2)
#> yaml 2.3.8 2023-12-11 [1] CRAN (R 4.3.2)
#>
#> [1] /home/jonathan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.3
#> [2] /usr/local/lib/R/site-library
#> [3] /usr/lib/R/site-library
#> [4] /usr/lib/R/library
#>
#> ──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
Bad color formulas are:
z < 3z < 4z < 5
The results from z < 2 may also be incorrect ... they're just indiscernible given my example.
This behavior causes significant skewing/confusion for bubble plots of any size.
Thanks for reading!
Hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Hướng nghiên cứu
Không có tệp nguồn hoặc bài kiểm thử nào được nêu tên. Bắt đầu bằng cách chạy các ví dụ plot_ly được cung cấp với các giá trị màu formula và tĩnh, sau đó truy vết cách dữ liệu marker size, color và name được ghép lại. Được xem là hoàn tất khi kích thước bong bóng vẫn được căn chỉnh với các hàng ban đầu qua các ngưỡng và trường hợp name được báo cáo, cùng với độ bao phủ hồi quy cho các ví dụ.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Đánh giá
- Công nghệ
- r
- Lĩnh vực
- data-visualization
- Loại issue
- Lỗi
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Độ rõ ràng
- Khá rõ ràng
- Mức phù hợp với người mới
- 35/100