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geom_GeomSignif() has yet to be implemented in plotly

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Langage dominant
R
Étoiles
2.7k
Forks
641
Métriques de merge des PR
Aucune PR mergée en 30 j

Description

Hi. I am using ggplot to draw bar functions. Tried to convert the ggplot to a plotly graph using ggplotly and got the message to open an issue since the geom_Geomsignif() has yet to be implemented in plotly.
here my code.
library(ggplot)
library(ggsignif)
library(plotly)
p <- ggplot()+geom_bar(data=plot_data1,mapping=aes(x=group,y=mean),fill="white",size=1.5,colour=c("#1E90FF","gold","red"),position=position_dodge(),stat="identity",width=0.6)+geom_jitter(data=plot_data2,mapping=aes(x=group,y=Retive_Abundance,fill=group,colour=group,shape=group),size=2,height=0.05,width=0.1)+scale_colour_manual(values=c("#1E90FF","gold","red"))+geom_signif(data=plot_data2,mapping=aes(x=group,y=Retive_Abundance),comparisons=list(c("N","P"),c("N","T"),c("P","T")),map_signif_level=F,tip_length=c(0,0,0,0,0,0),y_position=c(38,43,40.5),size=1,textsize = 3,test = "t.test")+geom_errorbar(data=plot_data1,mapping=aes(x = group,ymin = mean-sd,ymax=mean+sd),width=0.3,colour=c("#1E90FF","gold","red"),size=0.8)+scale_y_continuous(limits =c(0, 48) ,expand = c(0,0))+theme_classic(base_line_size = 1)+labs(title="White blood cell(WBC)",x="",y="Retive_Abundance")+theme(plot.title=element_text(size = 15,colour="black",hjust = 0.5),axis.title.y = element_text(size=15,colour="black",face="bold",vjust = .5,hjust=0.5,angle=90),legend.title=element_text(size=15,colour="black",face="bold"),legend.text=element_text(size=10,colour="black",face="bold"),axis.text=element_text(size=13,colour="black",face="bold",vjust = 0.5,hjust=0.5,angle=0))
ggplotly(p)
Warning message:
In geom2trace.default(dots[[1L]][[1L]], dots[[2L]][[1L]], dots[[3L]][[1L]]) :
geom_GeomSignif() has yet to be implemented in plotly.
If you'd like to see this geom implemented,
Please open an issue with your example code at
https://github.com/ropensci/plotly/issues

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Piste de recherche

Commencez au point d’entrée geom2trace.default indiqué dans l’avertissement et reproduisez le problème avec l’exemple fourni utilisant ggplot, ggsignif et plotly. Le travail est terminé lorsque ggplotly gère geom_signif sans l’avertissement et affiche les annotations de significativité dans le graphique obtenu.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
plotly, r
Domaine
data-visualization
Type d'issue
Fonctionnalité
Difficulté
4/5
Temps estimé
3-5 jours
Activité
À l'abandon
Clarté
Plutôt claire
Accessibilité débutants
35/100

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