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Grouping by color and/or symbol changes the order of error_y bars

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R
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説明

Reopening issues #762 and #1110, this is still happening in 2019 and maybe I found the cause.
Briefly, error bars displayed by error_x and error_y appear in the wrong order when grouping data by color or (as I found) symbol. Recycling @Cristoforetti 's code from #1110:

df<-data.frame("X"=c(1:20),
"Y"=c(1:20),
"SD"=c(1:20),
"G"=c(rep("A",3),rep("B",5),rep("C",4),rep("D",5),rep("A",3)),
"g"=c(rep("a",2),rep("b",5),rep("c",4),rep("d",5),rep("e",4))
)
# no grouping; error bars correct
p1<-plot_ly(df,
            x=~X,
            y=~Y,
            type="scatter",
            mode="markers",
            error_y =list(
              array=~SD,
              thickness=1
            )
)
# grouping by color; error bars wrong
p2<-plot_ly(df,
            x=~X,
            y=~Y,
            color=~G,
            type="scatter",
            mode="markers",
            error_y =list(array=~SD,
                          thickness=1
            )
)
subplot(p1,p2)

image
I found that the correct behaviour (error bars associated with the correct data points) can be restored by passing a version of the input dataframe order-ed by the color column:

# ordering the input data frame by the color column yields the correct behaviour
p3<-plot_ly(df[order(df$G),],
            x=~X,
            y=~Y,
            color=~G,
            type="scatter",
            mode="markers",
            error_y =list(array=~SD,
                          thickness=1
            )
)
subplot(p1,p2,p3)

image
The same happens when ordering by symbol: the error bars are screwed up unless df is order-ed by the symbol column. When using both color and symbol, one must order by both the color column and the symbol column in this order:

# using "G" for color and "g" for symbols; ordering by G, then g yields the correct behaviour
p4<-plot_ly(df[order(df$G,df$g),],
            x=~X,
            y=~Y,
            symbol=~g,
            color=~G,
            type="scatter",
            mode="markers",
            error_y =list(array=~SD,
                          thickness=1
            )
)
# ordering by g, then G yields the wrong behaviour
p5<-plot_ly(df[order(df$g,df$G),],
            x=~X,
            y=~Y,
            symbol=~g,
            color=~G,
            type="scatter",
            mode="markers",
            error_y =list(array=~SD,
                          thickness=1
            )
)
subplot(p4,p5)

image

What seems to be happening here is that color and symbol are reordering the (copy of) df handled by plotl_ly, but for some reason the reordering only affects the columns identified by x, y, color and symbol; as a consequence, the column used by error_y is now in the wrong order, and error bars are associated with the wrong data points. Ordering the df prior to calling plot_ly, or passing an ordered version of it, solves the issue. Still, it would be great to see this fixed in future versions of plotly.

コントリビューションガイド

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はじめの一歩

  1. issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
  2. 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
  3. リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
  4. issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。

調査の方向性

まず、提供されたデータフレームを使って再現可能な plot_ly と subplot の例を実行し、グループ化された入力と事前に順序付けされた入力を比較します。色とシンボルのグループ化の挙動を追跡し、error_y の値が元の点との関連付けを維持していることを確認します。手動で順序付けしなくてもエラーバーが正しく整列したままになることをもって完了とします。

索引モデルが issue の本文から書いたものです。

評価

技術スタック
plotly, r
領域
data-visualization
issue の種類
バグ
難易度
4/5
見積もり時間
3〜5日
活発さ
停滞
明瞭さ
おおむね明確
初心者へのやさしさ
45/100

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