Add Primitive repository APIs (`ResourceRepository`, `ToolsRepository`, ... )

Currently, McpStatelessAsyncServer and McpAsyncServer save resources, tools, prompts, and completionswithCopyOnWriteArrayList`.

https://github.com/modelcontextprotocol/java-sdk/blob/main/mcp-core/src/main/java/io/modelcontextprotocol/server/McpStatelessAsyncServer.java#L60-L68

I want to provide an API (for example, ResourcesRepository) that, by default, uses the current in-memory strategy but can be replaced, for example, by a dynamic implementation that returns a different list of resources depending on the currently authenticated user.

McpStatelessAsyncServer.java と McpAsyncServer.java から始め、特に issue で参照されている CopyOnWriteArrayList フィールドを確認し、リソース、ツール、プロンプト、completions がどのように保存され、提供されているかを追跡します。現在のインメモリ動作を維持し、ユーザー依存の実装を可能にしながら、repository の API 境界を定義します。4 つすべての primitive collection が置き換え可能な API を使用し、既存のサーバー動作を変更しないことを完了条件とします。