matplotlib / matplotlib/basemap

addcyclic problem with grib2 data

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主要语言
Python
星标
817
派生
395
PR 合并指标
30 天内没有已合并 PR

描述

I have some problems to use add cyclic with data from grib2 file.

This is my code:

# -*- coding: utf-8 -*-

import pygrib
import numpy as np

from matplotlib.backends.backend_agg import FigureCanvasAgg as FigureCanvas
from matplotlib.figure import Figure

from mpl_toolkits.basemap import Basemap, addcyclic

fig = Figure((4, 3))
canvas = FigureCanvas(fig)
ax = fig.add_axes([0.05, 0.05, 0.9, 0.9])

# File download from http://para.nomads.ncep.noaa.gov/pub/data/nccf/com/gfs/para/gfs.2016041918/gfs.t18z.pgrb2.0p25.f000
grbindx = pygrib.index('gfs.t18z.pgrb2.0p25.f000', 'shortName', 'typeOfLevel', 'level')
grb = grbindx.select(shortName='2t', typeOfLevel='heightAboveGround', level=2)[0]
lats, lons  = grb.latlons()
temp = grb.values

temp, lons = addcyclic(temp, lons)

bm = Basemap(projection='mill', resolution='l', ax=ax,
    llcrnrlat=32, urcrnrlat=70, llcrnrlon=-25,
    urcrnrlon=40.5, lat_ts=20)

x, y = bm(lons, lats)
bm.contourf(x, y, temp)

bm.drawcoastlines()

canvas.print_figure('gfs_temperature_2m.png', dpi=100)

With python 2.7.11 and basemap 1.0.7 this is the result:

Traceback (most recent call last):
  File "addcyclic.py", line 21, in <module>
    temp, lons = addcyclic(temp, lons)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/mpl_toolkits/basemap/__init__.py", line 5062, in addcyclic
    lonsout[0:nlons] = lonsin[:]
ValueError: could not broadcast input array from shape (721,1440) into shape (1440)

With python 2.7.11 and basemap 1.0.8 (from latest github commit) this is the result:

Traceback (most recent call last):
  File "addcyclic.py", line 27, in <module>
    x, y = bm(lons, lats)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/mpl_toolkits/basemap/__init__.py", line 1175, in __call__
    xout,yout = self.projtran(x,y,inverse=inverse)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/mpl_toolkits/basemap/proj.py", line 286, in __call__
    outx,outy = self._proj4(x, y, inverse=inverse)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pyproj/__init__.py", line 399, in __call__
    _proj.Proj._fwd(self, inx, iny, radians=radians, errcheck=errcheck)
  File "_proj.pyx", line 128, in _proj.Proj._fwd (_proj.c:1678)
RuntimeError: Buffer lengths not the same

Where is the problem?
Some bug in basemap? Or in my code?

Without addcycle this is the result:
gfs_temperature_2m

Thanks
Andrew

贡献指南

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  1. 先读完整个 Issue,再读项目的贡献指南。
  2. 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
  3. Fork 仓库,在一个分支上完成修改。
  4. 提交 Pull Request,并在描述里引用这个 Issue 编号。

调研方向

使用指定的 Basemap 版本运行提供的 Python 脚本,并检查 addcyclic 调用,随后检查 Basemap.call 以及报告的 pyproj 转换。比较 addcyclic 前后 temp、lons 和 lats 的形状。完成的标准是 GRIB2 示例能够运行结束,坐标数组彼此匹配,并生成预期的等高线图。

由索引模型根据 Issue 内容生成。

评估

技术栈
matplotlib, numpy, python
领域
data-visualization
Issue 类型
缺陷
难度
3/5
预计耗时
1-2 天
活跃度
停滞
描述清晰度
基本清楚
新手友好度
35/100

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