matplotlib / matplotlib/basemap

addcyclic problem with grib2 data

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Lenguaje dominante
Python
Estrellas
817
Forks
395
Métricas de merge de PR
Sin PR fusionados en 30 d

Descripción

I have some problems to use add cyclic with data from grib2 file.

This is my code:

# -*- coding: utf-8 -*-

import pygrib
import numpy as np

from matplotlib.backends.backend_agg import FigureCanvasAgg as FigureCanvas
from matplotlib.figure import Figure

from mpl_toolkits.basemap import Basemap, addcyclic

fig = Figure((4, 3))
canvas = FigureCanvas(fig)
ax = fig.add_axes([0.05, 0.05, 0.9, 0.9])

# File download from http://para.nomads.ncep.noaa.gov/pub/data/nccf/com/gfs/para/gfs.2016041918/gfs.t18z.pgrb2.0p25.f000
grbindx = pygrib.index('gfs.t18z.pgrb2.0p25.f000', 'shortName', 'typeOfLevel', 'level')
grb = grbindx.select(shortName='2t', typeOfLevel='heightAboveGround', level=2)[0]
lats, lons  = grb.latlons()
temp = grb.values

temp, lons = addcyclic(temp, lons)

bm = Basemap(projection='mill', resolution='l', ax=ax,
    llcrnrlat=32, urcrnrlat=70, llcrnrlon=-25,
    urcrnrlon=40.5, lat_ts=20)

x, y = bm(lons, lats)
bm.contourf(x, y, temp)

bm.drawcoastlines()

canvas.print_figure('gfs_temperature_2m.png', dpi=100)

With python 2.7.11 and basemap 1.0.7 this is the result:

Traceback (most recent call last):
  File "addcyclic.py", line 21, in <module>
    temp, lons = addcyclic(temp, lons)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/mpl_toolkits/basemap/__init__.py", line 5062, in addcyclic
    lonsout[0:nlons] = lonsin[:]
ValueError: could not broadcast input array from shape (721,1440) into shape (1440)

With python 2.7.11 and basemap 1.0.8 (from latest github commit) this is the result:

Traceback (most recent call last):
  File "addcyclic.py", line 27, in <module>
    x, y = bm(lons, lats)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/mpl_toolkits/basemap/__init__.py", line 1175, in __call__
    xout,yout = self.projtran(x,y,inverse=inverse)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/mpl_toolkits/basemap/proj.py", line 286, in __call__
    outx,outy = self._proj4(x, y, inverse=inverse)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pyproj/__init__.py", line 399, in __call__
    _proj.Proj._fwd(self, inx, iny, radians=radians, errcheck=errcheck)
  File "_proj.pyx", line 128, in _proj.Proj._fwd (_proj.c:1678)
RuntimeError: Buffer lengths not the same

Where is the problem?
Some bug in basemap? Or in my code?

Without addcycle this is the result:
gfs_temperature_2m

Thanks
Andrew

Guía de contribución

No hay ninguna guía de contribución indexada para este repositorio

Primeros pasos

  1. Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
  2. Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
  3. Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
  4. Abre un pull request que haga referencia al número del issue.

Línea de trabajo

Ejecute el script de Python proporcionado con las versiones de Basemap indicadas e inspeccione la llamada a addcyclic, seguida de Basemap.call y de la conversión de pyproj indicada. Compare las formas de temp, lons y lats antes y después de addcyclic. Se considera completado cuando el ejemplo de GRIB2 termina con arrays de coordenadas coincidentes y produce el gráfico de contornos previsto.

Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.

Evaluación

Stack tecnológico
matplotlib, numpy, python
Área
data-visualization
Tipo de issue
Error
Dificultad
3/5
Tiempo estimado
1-2 días
Estado de actividad
Estancado
Claridad
Bastante claro
Aptitud para principiantes
35/100

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